Porównanie pięciu miar zróżnicowania genetycznego polskich odmian pszenicy ocenianych na podstawie danych z analiz markerów mikrosatelitarnych

Jan Bocianowski

jan.bocianowski@up.poznan.pl
Katedra Metod Matematycznych i Statystycznych, Akademia Rolnicza w Poznaniu (Poland)

Łukasz Stępień


Instytut Genetyki Roślin, Polskiej Akademii Nauk w Poznaniu (Poland)

Abstrakt

Celem pracy było zbadanie zgodności wyników oceny zróżnicowania genetycznego polskich odmian pszenicy za pomocą pięciu miar: Jaccarda, Kulczynskiego, Sokala i Michenera, Nei’a, Rogersa. Materiał do badań stanowiły 53 polskie odmiany pszenicy. Zróżnicowanie genetyczne odmian oceniano na podstawie 164 markerów molekularnych typu SSR. Stwierdzono największe wartości miary zróżnicowania genetycznego Jaccarda. Stwierdzono istotne dodatnie skorelowanie miar Jaccarda, Kulczynskiego, Sokala i Michenera oraz Nei’a. Miara Rogersa oceny zróżnicowania genetycznego pozwala uzyskać wyniki odmienne od pozostałych porównywanych miar.


Słowa kluczowe:

markery mikrosatelitarne, pszenica, zróżnicowanie genetyczne

Burkhamer R. L., Lanning S. P., Martens R. J., Martin J. M., Talbert L. E. 1998. Predicting progeny variance from parental divergence in hard red spring wheat. Crop Sci. 38: 243 — 248. DOI: https://doi.org/10.2135/cropsci1998.0011183X003800010041x
Google Scholar

Dillmann C., Bar-Hen A., Guérin D., Charcosset A., Murigneux A. 1997. Comparison of RFLP and morphological distance between maize Zea mays L. inbred lines. Consequences for germplasm protection purposes. Theor. Appl. Genet. 95: 92 — 102. DOI: https://doi.org/10.1007/s001220050536
Google Scholar

Heckenberger M., Bohnb M., Klein D., Melchinger A. E. 2005. Identification of essentially derived varieties obtained from biparental crosses of homozygous lines. II. Morphological distances and heterosis in comparison with simple sequence repeat and amplified fragment length polymorphism data in maize. Crop Sci. 45: 1132 — 1140. DOI: https://doi.org/10.2135/cropsci2004.0111
Google Scholar

Huang X. Q., Boerner A., Roeder M. S., Ganal M. W. 2002. Assessing genetic diversity of wheat (Triticum aestivum L.) germplasm using microsatellite markers. Theor. Appl. Genet. 105: 699 — 707. DOI: https://doi.org/10.1007/s00122-002-0959-4
Google Scholar

Jaccard P. 1908. Nouvelles recherches sur la distribution florale. Bull. Soc. Vaud. Sci. Nat. 44: 223 — 270.
Google Scholar

Kim H. S., Ward R. W. 2000. Patterns of RFLP-based genetic diversity in germplasm pools of common wheat with different geographical or breeding program origins. Euphytica 115: 197 — 208. DOI: https://doi.org/10.1023/A:1004022601879
Google Scholar

Kuczyńska A., Milczarski P., Surma M., Masojć P., Adamski T. 2001. Genetic diversity among cultivars of spring barley revealed by random amplified polymorphic DNA (RAPD). J. Appl. Genet. 42(1): 43 — 48.
Google Scholar

Kulczynski S. 1927. Die Pflanzenassoziationen der Pieninen. Bull. Intern. Acad. Pol. Sci. Lett. Cl. Sci. Math. Nat., B (Sci. Nat.) 1927 (Suppl. 2): 57 — 203.
Google Scholar

Mądry W., Śmiałowski T., Ukalski K. 2005. Przewidywanie średnich cechy w populacjach potomstwa na podstawie parametrów biometryczno-genetycznych rodziców: modele i ich zastosowanie dla żyta ozimego. Biul. IHAR 235: 251 — 268.
Google Scholar

Myśków B., Masojć P., Banek-Tabor A., Szolkowski A. 2001. Genetic diversity of inbred rye lines evaluated by RAPD analysis. J. Appl. Genet. 42 (1): 1 — 14.
Google Scholar

Nei M. 1972. Genetic distance between populations. Am. Nat. 106: 283 — 292. DOI: https://doi.org/10.1086/282771
Google Scholar

Patzak J. 2001. Comparison of RAPD, STS, ISSR, and AFLP molecular methods used for assessment of genetic diversity in hop (Humulus lupulus L.). Euphytica 121: 9 — 18.
Google Scholar

Pestsova E., Korzun V., Goncharov N. P., Hammer K., Ganal M. W., Roeder M. S. 2000. Microsatellite analysis of Aegilops tauschii germplasm. Theor. Appl. Genet. 101: 100 — 106. DOI: https://doi.org/10.1007/s001220051456
Google Scholar

Plaschke J., Ganal M. W., Roeder M. S. 1995. Detection of genetic diversity in closely related bread wheat using microsatellite markers. Theor. Appl. Genet. 91: 1001 — 1007. DOI: https://doi.org/10.1007/BF00223912
Google Scholar

Powell W., Morgante W. M., Andre C., Hanafrey M., Vogel J., Tingey S., Rafalski A. 1996. Comparison of RFLP, RAPD, AFLP and SSR (microsatellite) markers for germplasm analysis. Mol. Breed. 2: 225 — 228. DOI: https://doi.org/10.1007/BF00564200
Google Scholar

Roeder M. S., Wendehake K., Korzun V., Bredemeijer G., Laborie D., Bertrand L., Isaac P., Rendell S., Jackson J., Cooke R. J., Vosmann B., Ganal M. W. 2002. Construction and analysis of a microsatellite-based database of European wheat cultivars. Theor. Appl. Genet. 106: 67 — 73. DOI: https://doi.org/10.1007/s00122-002-1061-7
Google Scholar

Rogers J. S. 1972. Measures of genetic similarity and genetic distance. Studies in Genetics, University of Texas Publication 7213: 145 — 153.
Google Scholar

Sokal R. R., Michener C. D. 1958. A statistical method for evaluating systematic relationships. Univ. Kansas Sci. Bull. 38: 1409 — 1438.
Google Scholar

Stępień Ł., Golka L., Chełkowski J. 2003. Leaf rust resistance genes of wheat: identification in cultivars and resistance sources. J. Appl. Genet. 44 (2): 139 — 149.
Google Scholar

Pobierz


Opublikowane
12/31/2006

Cited By / Share

Bocianowski, J. i Stępień, Łukasz (2006) „Porównanie pięciu miar zróżnicowania genetycznego polskich odmian pszenicy ocenianych na podstawie danych z analiz markerów mikrosatelitarnych”, Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin, (242), s. 27–32. doi: 10.37317/biul-2006-0003.

Autorzy

Jan Bocianowski 
jan.bocianowski@up.poznan.pl
Katedra Metod Matematycznych i Statystycznych, Akademia Rolnicza w Poznaniu Poland

Autorzy

Łukasz Stępień 

Instytut Genetyki Roślin, Polskiej Akademii Nauk w Poznaniu Poland

Statystyki

Abstract views: 24
PDF downloads: 5


Licencja

Prawa autorskie (c) 2024 Jan Bocianowski, Łukasz Stępień

Creative Commons License

Utwór dostępny jest na licencji Creative Commons Uznanie autorstwa – Na tych samych warunkach 4.0 Miedzynarodowe.

Z chwilą przekazania artykułu, Autorzy udzielają Wydawcy niewyłącznej i nieodpłatnej licencji na korzystanie z artykułu przez czas nieokreślony na terytorium całego świata na następujących polach eksploatacji:

  1. Wytwarzanie i zwielokrotnianie określoną techniką egzemplarzy artykułu, w tym techniką drukarską oraz techniką cyfrową.
  2. Wprowadzanie do obrotu, użyczenie lub najem oryginału albo egzemplarzy artykułu.
  3. Publiczne wykonanie, wystawienie, wyświetlenie, odtworzenie oraz nadawanie i reemitowanie, a także publiczne udostępnianie artykułu w taki sposób, aby każdy mógł mieć do niego dostęp w miejscu i w czasie przez siebie wybranym.
  4. Włączenie artykułu w skład utworu zbiorowego.
  5. Wprowadzanie artykułu w postaci elektronicznej na platformy elektroniczne lub inne wprowadzanie artykułu w postaci elektronicznej do Internetu, lub innej sieci.
  6. Rozpowszechnianie artykułu w postaci elektronicznej w internecie lub innej sieci, w pracy zbiorowej jak również samodzielnie.
  7. Udostępnianie artykułu w wersji elektronicznej w taki sposób, by każdy mógł mieć do niego dostęp w miejscu i czasie przez siebie wybranym, w szczególności za pośrednictwem Internetu.

Autorzy poprzez przesłanie wniosku o publikację:

  1. Wyrażają zgodę na publikację artykułu w czasopiśmie,
  2. Wyrażają zgodę na nadanie publikacji DOI (Digital Object Identifier),
  3. Zobowiązują się do przestrzegania kodeksu etycznego wydawnictwa zgodnego z wytycznymi Komitetu do spraw Etyki Publikacyjnej COPE (ang. Committee on Publication Ethics), (http://ihar.edu.pl/biblioteka_i_wydawnictwa.php),
  4. Wyrażają zgodę na udostępniane artykułu w formie elektronicznej na mocy licencji CC BY-SA 4.0, w otwartym dostępie (open access),
  5. Wyrażają zgodę na wysyłanie metadanych artykułu do komercyjnych i niekomercyjnych baz danych indeksujących czasopisma.

Inne teksty tego samego autora

1 2 3 4 > >>