Chromosomowa lokalizacja markerów tolerancyjności na glin u żyta
Iwona Wiśniewska
i.wisniewska@ihar.edu.plZakład Biochemii i Fizjologii Roślin, Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin, Radzików (Poland)
Andrzej Rafalski
Zakład Biochemii i Fizjologii Roślin, Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin, Radzików (Poland)
Abstrakt
W badaniach mających na celu lokalizację fragmentów DNA na chromosomach żyta wykorzystuje się zwykle zestaw linii addycyjnych pszenica-żyto i bardziej stabilne zestawy linii substytucyjnych pszenżyta. Pochodzenie fragmentu DNA z określonego chromosomu żyta potwierdza jego hybrydyzacja z DNA linii addycyjnej przy jednoczesnym obniżeniu intensywności sygnału do analogicznej linii substytucyjnej pszenżyta. Spontaniczna utrata chromosomów żyta w liniach addycyjnych stwarza konieczność weryfikacji posiadanego materiału. Obecność addycji chromosomów żyta w pszenicy Chinese Spring potwierdzono metodą hybrydyzacji przy użyciu dwóch sond molekularnych charakterystycznych dla żytniej sekwencji powtarzającej się typu rozproszonego. Wyniki analiz DNA 103 pojedynczych siewek linii addycyjnych przy użyciu obu sond były zgodne i wykazały znaczne zróżnicowanie obecności DNA żyta. Do badań nad lokalizacją fragmentów DNA na chromosomach żyta wybrano DNA pojedynczych siewek linii addycyjnych, które z sondami charakteryzującymi żyto dawały silny i podobny sygnał hybrydyzacyjny. Spośród 18 fragmentów różnicujących tolerancyjne i wrażliwe formy żyta 4 wykazywały wzrost intensywności hybrydyzacji do DNA linii addycyjnej z chromosomami 4R przy jednoczesnym obniżeniu tego efektu dla substytucji 4R/4D. W pozostałych przypadkach nie obserwowano zmian intensywności sygnału hybrydyzacyjnego lub różnice ujawniające się w liniach addycyjnych i substytucyjnych nie były ze sobą zgodne.
Słowa kluczowe:
hybrydyzacja, lokalizacja na chromosomach, markery, tolerancyjność na glin, żytoBibliografia
Anamthawat-Jonsson K., Schwarzacher T., Leitch A. R., Bennett M. D., Heslop-Harrison J. S. 1990. Discrimination between closely related Triticeae species using genomic DNA as a probe. Theor. Appl. Genet. 79: 721 — 728.
DOI: https://doi.org/10.1007/BF00224236
Google Scholar
Anioł A.1981. Metody określania tolerancyjności zbóż na toksyczne działanie jonów glinu. Biul. IHAR 143: 3 — 14.
Google Scholar
Davis L. G., Dibner M. D., Battey J. F. 1986. Basic methods in molecular biology. Elsevier Sci. Publ., New York: 42 — 43.
DOI: https://doi.org/10.1016/B978-0-444-01082-7.50018-7
Google Scholar
Gallego F. J., Lopez-Solanilla E., Figueiras A. M., Benito C. 1998. Chromosomal location of PCR fragments as a source of DNA markers linked to aluminium tolerance genes in rye. Theor. Appl. Genet. 96: 426 — 434.
DOI: https://doi.org/10.1007/s001220050759
Google Scholar
Konieczny A., Ausubel F. A. 1993. A procedure for mapping Arabidopsis mutations using co-dominant ecotype-specific PCR-based markers. The Plant Journal 4: 403 — 410.
DOI: https://doi.org/10.1046/j.1365-313X.1993.04020403.x
Google Scholar
Łukaszewski A. J. 1988. A comparison of several approaches in the development of disomic alien addition lines of wheat. Proc. 7th Int. Wheat Genet. Symp. Cambridge, England: 363 — 367.
Google Scholar
Metzlaff M., Troebner W., Baldauf F., Schlegel R., Cullum J. 1986. Wheat specific repetitive DNA sequences — construction and characterisation of four different genomic clones. Theor. Appl. Genet. 72: 207 — 210.
DOI: https://doi.org/10.1007/BF00266993
Google Scholar
Michelmore, R. W., Paran, I., Kessell, R. V. 1991. Identification of markers linked to disease-resistance genes by bulked segregant analysis: a rapid method to detect markers in specific genomic regions by using segreganting populations. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 88: 9828 — 9832.
DOI: https://doi.org/10.1073/pnas.88.21.9828
Google Scholar
Miftahudin, Scoles G. J., Gustafson, J. P. 2002. AFLP markers tightly linked to the aluminium-tolerance gene Alt3 in rye (Secale cereale L.). Theor. Appl. Genet. 104: 626 — 631.
DOI: https://doi.org/10.1007/s00122-001-0782-3
Google Scholar
Rafalski A., Wiśniewska I., Anioł A. 1996. Screening for molecular markers of aluminium tolerance in rye. J. Appl. Genet. 37A: 79 — 81.
Google Scholar
Rafalski A., Wiśniewska I., Sikora T., Łapiński B. 2000. Molecular probes for detection of wheat chromosomal fragments in rye. Plant Breeding and Seed Science 44: 27 — 38.
Google Scholar
Rafalski A., Madej L., Wiśniewska I., Gaweł M. 2002. The genetic diversity of components of rye hybrids. Cell. Mol. Biol. Lett. 7: 471 — 475.
Google Scholar
Rogowsky P. M., Shepard K. W., Langridge P. 1992. Polymerase chain reaction mapping of rye involving repeated DNA sequences. Genome 35: 621 — 626.
DOI: https://doi.org/10.1139/g92-093
Google Scholar
Saiki R. K., Scharf S., Faloona F., Mullis K. B., Horn G. T., Erlich H. A., Arnheim N. 1985. Enzymatic amplification of beta-globin genomic sequences and restriction analysis of sickle-cell anemia. Science 230: 1350 — 1354.
DOI: https://doi.org/10.1126/science.2999980
Google Scholar
Autorzy
Iwona Wiśniewskai.wisniewska@ihar.edu.pl
Zakład Biochemii i Fizjologii Roślin, Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin, Radzików Poland
Autorzy
Andrzej RafalskiZakład Biochemii i Fizjologii Roślin, Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin, Radzików Poland
Statystyki
Abstract views: 62PDF downloads: 29
Licencja
Prawa autorskie (c) 2003 Iwona Wiśniewska, Andrzej Rafalski
Utwór dostępny jest na licencji Creative Commons Uznanie autorstwa – Na tych samych warunkach 4.0 Miedzynarodowe.
Z chwilą przekazania artykułu, Autorzy udzielają Wydawcy niewyłącznej i nieodpłatnej licencji na korzystanie z artykułu przez czas nieokreślony na terytorium całego świata na następujących polach eksploatacji:
- Wytwarzanie i zwielokrotnianie określoną techniką egzemplarzy artykułu, w tym techniką drukarską oraz techniką cyfrową.
- Wprowadzanie do obrotu, użyczenie lub najem oryginału albo egzemplarzy artykułu.
- Publiczne wykonanie, wystawienie, wyświetlenie, odtworzenie oraz nadawanie i reemitowanie, a także publiczne udostępnianie artykułu w taki sposób, aby każdy mógł mieć do niego dostęp w miejscu i w czasie przez siebie wybranym.
- Włączenie artykułu w skład utworu zbiorowego.
- Wprowadzanie artykułu w postaci elektronicznej na platformy elektroniczne lub inne wprowadzanie artykułu w postaci elektronicznej do Internetu, lub innej sieci.
- Rozpowszechnianie artykułu w postaci elektronicznej w internecie lub innej sieci, w pracy zbiorowej jak również samodzielnie.
- Udostępnianie artykułu w wersji elektronicznej w taki sposób, by każdy mógł mieć do niego dostęp w miejscu i czasie przez siebie wybranym, w szczególności za pośrednictwem Internetu.
Autorzy poprzez przesłanie wniosku o publikację:
- Wyrażają zgodę na publikację artykułu w czasopiśmie,
- Wyrażają zgodę na nadanie publikacji DOI (Digital Object Identifier),
- Zobowiązują się do przestrzegania kodeksu etycznego wydawnictwa zgodnego z wytycznymi Komitetu do spraw Etyki Publikacyjnej COPE (ang. Committee on Publication Ethics), (http://ihar.edu.pl/biblioteka_i_wydawnictwa.php),
- Wyrażają zgodę na udostępniane artykułu w formie elektronicznej na mocy licencji CC BY-SA 4.0, w otwartym dostępie (open access),
- Wyrażają zgodę na wysyłanie metadanych artykułu do komercyjnych i niekomercyjnych baz danych indeksujących czasopisma.
Inne teksty tego samego autora
- Andrzej Rafalski, Magdalena Żurawska, Irena Kolasińska, Iwona Wiśniewska, Molekularna analiza linii męskosterylnych, dopełniaczy sterylności i restorerów płodności żyta , Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin: Nr 235 (2005): Wydanie regularne
- Andrzej Rafalski, Małgorzata Gaweł, Iwona Wiśniewska, Analiza zróżnicowania genetycznego komponentów mieszańców żyta , Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin: Nr 230 (2003): Wydanie regularne
- Andrzej Rafalski, Iwona Wiśniewska, Krzysztof Klimont, Zmiany profilu fragmentów DNA po traktowaniu nasion grochu siewnego i fasoli promieniowaniem laserowym , Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin: Nr 220 (2001): Wydanie regularne
- Andrzej Rafalski, Iwona Wiśniewska, Krzysztof Klimont, Zmiany obrazu fragmentów DNA po traktowaniu nasion jęczmienia promieniowaniem laserowym , Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin: Nr 218/219 (2001): Wydanie regularne
- Iwona Wiśniewska, Andrzej Rafalski, Lucjan Madej, Analiza zmienności genetycznej linii żyta i ich wyrównania , Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin: Nr 218/219 (2001): Wydanie regularne
