Poszukiwanie markerów molekularnych związanych z przebiegiem kwitnienia linii rodzicielskich mieszańców F1 CMS ogura rzepaku ozimego (B. napus L.)
Alina Lieesch
a.liersh@ihar.edu.plZakład Genetyki i Hodowli Roślin Oleistych, IHAR — PIB Poznań (Poland)
Jan Bocianowski
Katedra Metod Matematycznych i Statystycznych, Uniwersytet Przyrodniczy w Poznaniu (Poland)
Iwona Bartkowiak-Broda
Zakład Genetyki i Hodowli Roślin Oleistych, IHAR — PIB Poznań (Poland)
Abstrakt
Wiele przeprowadzonych dotąd badań wykazało, że istnieje pozytywny związek plonu nasion rzepaku z wczesnością i długością kwitnienia. Ze względu na ukierunkowanie w ostatnich latach hodowli rzepaku przede wszystkim na tworzenie odmian mieszańcowych F1 podjęto badania mające na celu znalezienie markerów molekularnych związanych z początkiem i długością kwitnienia komponentów rodzicielskich mieszańców F1 CMS ogura. Początek i długość kwitnienia 18 linii rodzicielskich oceniono w doświadczeniach polowych w dwóch kolejnych sezonach wegetacyjnych, w dwóch środowiskach. Badania genomowego DNA tych linii wykonano metodą PCR — RAPD i AFLP, a ponadto w badaniach wykorzystano także markery izoenzymatyczne. Stwierdzono istotny statystycznie związek pomiędzy markerami molekularnymi a początkiem terminu kwitnienia (16 markerów) oraz długością okresu kwitnienia (32 markery). Nie stwierdzono takiej zależności z markerami izoenzymatycznymi.
Instytucje finansujące
Bibliografia
Bocianowski J. 2012. Analytical and numerical comparisons of two methods of estimation of additive × additive interaction of QTL effects. Scientia Agricola 69 (4): 240 — 246.
Google Scholar
Bocianowski J., Liersch A., Bartkowiak-Broda I. 2010. Zależność plonu nasion mieszańców F1 CMS ogura rzepaku ozimego (Brassica napus L.) od wybranych cech fenotypowych roślin oceniona przy zastosowaniu analizy regresji wielokrotnej. Rośliny Oleiste — Oilseed Crops, XXXVI (2): 373 — 389.
Google Scholar
Bocianowski J., Kozak M., Liersch A., Bartkowiak-Broda I. 2011. A heuristic method of searching for interesting markers in terms of quantitative traits. Euphytica 181: 89 — 100.
Google Scholar
Bocianowski J., Seidler-Łożykowska K. 2012. The relationship between RAPD markers and quantitative traits of caraway (Carum carvi L.). Industrial Crops and Products 36: 135 — 139.
Google Scholar
Cai C. C., Tu J., Fu T. D., Chen B. Y. 2008. The genetic basis of flowering time and photoperiod sensitivity in rapeseed Brassica napus L. Russ. J. Genet 44: 326 — 333.
Google Scholar
Doyle J. J., Doyle J. L. 1990. Isolation of plant DNA from fresh tissue. Focus 12: 13—15.
Google Scholar
Federico L. I. L., Federico, M. L. 2011. The genetics of Brassica napus. In: Genetics and genomics of the Brassicaceae, plant genetics and genomics: Crops and Models 9 (eds.) R. Schmidt, I. Bancroft. Springer Science +Business Media, LLC 2011. DOI 10.1007/978-1-4419-7118-0_10: 291 — 312.
Google Scholar
GenStat. 2007. GenStat Release 10 Reference Manual. Lawes Agricultural Trust, Rothamsted, UK.
Google Scholar
Hastie T. J., Tibshirani R. J. 1990. Generalized additive models. Chapman and Hall, London.
Google Scholar
Irzykowska, L., Bocianowski, J. 2008. Genetic variation, pathogenicity and mycelial growth rate differentiation between Gaeumannomyces graminis var. tritici isolates derived from winter and spring wheat. Annals of Applied Biology 152: 369 — 375.
Google Scholar
Irzykowska L., Bocianowski J., Waśkiewicz A., Weber Z., Karolewski Z., Goliński P., Kostecki M., Irzykowski W. 2012. Genetic variation of Fusarium oxysporum isolates forming fumonisin B1 and moniliformin. Journal of Applied Genetics 53: 237 — 247.
Google Scholar
Jourdren C., Barret P., Brunel D., Delourme R., Renard M. 1996. Specific molecular marker of the genes controlling linolenic acid content in rapeseed. Theor. Appl. Genet. 93: 512 — 518.
Google Scholar
Lagercrantz U. 1998. Comparative mapping between Arabidopsis thaliana and Brassica nigra indicates that Brassica genomes have evolved through extensive genome replication accompanied by chromosomes fusions and frequent rearrangements. Genetics 150: 1217 — 1228.
Google Scholar
Lande R., Thompson R. 1990. Efficiency of marker-assisted selection in the improvement of quantitative traits. Genetics 124: 743 — 756.
Google Scholar
Long Y., Shi J., Qiu D., Li R., Zhang C., Wang J., Hou J., Zhao J., Shi L., Park B-S., Choi SR., Lim YP., Meng J. 2007. Flowering time quantitative trait loci analysis of oilseed brassica in multiple environments and genome wide alignment with Arabidopsis. Genetics 177: 2433 — 2444.
Google Scholar
Mei D. S., Wang H. Z., Hu Q., Li Y. D., Xu Y.S., Li Y. C. 2009. QTL analysis on plant height and flowering time in Brassica napus. Plant Breeding 128: 458 — 465.
Google Scholar
Ogrodowczyk M., Liersch A., Bartkowiak-Broda I. 2003. Badanie zależności plonu nasion od cech biometrycznych u odmian mieszańcowych i populacyjnych rzepaku ozimego. Biul. IHAR 226/227/2: 415 — 424.
Google Scholar
Oil World 17/2010. Za Rynek Rzepaku Stan i Perspektywy. 2010. Instytut Ekonomiki Rolnictwa i Gospodarki Żywnościowej PIB, Agencja Rynku Rolnego, MRiRW. ISSN 1231-269X.
Google Scholar
Osborn T. C., Kole C., Parkin I. A. P., Sharpe A. G., Kuiper M., Lydiate D. J., Trick M. 1997. Comparison of flowering time genes in Brassica rapa, B. napus and Arabidopsis thaliana. Genetics 146: 1123 — 1129.
Google Scholar
Osborn T.C., Lukens L. 2003. The molecular genetic basis of flowering time variation in Brassica species. In: Nagata T., Tabata S. (eds.) Biotechnology in agriculture and forestry. Brassica and legumes: from gene structure to breeding. Springer Verlag, Berlin, 69 — 86.
Google Scholar
Raman H., Pragnell R., Eckermann P., Edwards D., Batley J., Coombers N., Taylor B., Wratten N., Luckett D., Dennis L. 2011. Genetic dissection of natural variation for flowering time in rapeseeds 13th International Rapeseed Congress, June 05-09.2011, Prague, Czech Republic, CD-ROM: 67 — 70, www.irc2011.org.
Google Scholar
Shields C. R., Orton C. J., Stuber C. W. 1983. Isozymes in plants genetics and breeding. In: Tanksley S. D. and Orton T. J. (Eds). Part A, Elsevier Sciences Publishers, B.V., Amsterdam: 443 — 458.
Google Scholar
Snowdon R.J., Friedt W. 2004. Molecular markers in Brassica oilseed breeding: current status and future possibilities. Plant Breeding 123: 1 — 8.
Google Scholar
Somers D. J., Rakow G., Prabhu V. K., Friesen K. R. D. 2001. Identification of a major gene and RAPD markers for yellow seed coat colour in Brassica napus. Genome 44: 1077 — 1082.
Google Scholar
Spasibionek S., Ogrodowczyk M. 1994. Badania nad nowymi rodami rzepaku ozimego w doświadczeniach wstępnych w sezonie 1992/93. Rośliny Oleiste — Oilseed Crops, XV: 341 — 358.
Google Scholar
Vallejos C. E. 1983. Enzyme activity staining. In: Tanksley S. D. and Orton T. J. (Eds). Isozymes in plants genetics and breeding. Part A, Elsevier Sciences Publishers, B.V., Amsterdam: 469 — 516.
Google Scholar
Vos P., Hogers R., Sleeker M., Reijans M., Lee T., Homes M., Freiters A., Pot J., Peleman J., Kuiper M., Zabeau M. 1995. AFLP: a new concept for DNA fingerprinting. Nucl. Acids Res. 23: 4404 — 4414.
Google Scholar
Williams J. G. K., Kubelik A. R., Livak K. J., Rafalski J. A., Tingey S. V. 1990. DNA polymorphisms amplified by arbitrary primers are useful as genetic markers. Nucl. Acids Res. 18: 6531 — 6535.
Google Scholar
Zhao H., Shi L., Duan X., Xu F., Wang Y., Jinling Meng J. 2008. Mapping and validation of chromosome regions conferring a new boron-efficient locus in Brassica napus. Mol. Breed. 22: 495 — 506.
Google Scholar
Autorzy
Alina Lieescha.liersh@ihar.edu.pl
Zakład Genetyki i Hodowli Roślin Oleistych, IHAR — PIB Poznań Poland
Autorzy
Jan BocianowskiKatedra Metod Matematycznych i Statystycznych, Uniwersytet Przyrodniczy w Poznaniu Poland
Autorzy
Iwona Bartkowiak-BrodaZakład Genetyki i Hodowli Roślin Oleistych, IHAR — PIB Poznań Poland
Statystyki
Abstract views: 83PDF downloads: 40
Licencja
Prawa autorskie (c) 2012 Alina Lieesch, Jan Bocianowski, Iwona Bartkowiak-Broda
Utwór dostępny jest na licencji Creative Commons Uznanie autorstwa – Na tych samych warunkach 4.0 Miedzynarodowe.
Z chwilą przekazania artykułu, Autorzy udzielają Wydawcy niewyłącznej i nieodpłatnej licencji na korzystanie z artykułu przez czas nieokreślony na terytorium całego świata na następujących polach eksploatacji:
- Wytwarzanie i zwielokrotnianie określoną techniką egzemplarzy artykułu, w tym techniką drukarską oraz techniką cyfrową.
- Wprowadzanie do obrotu, użyczenie lub najem oryginału albo egzemplarzy artykułu.
- Publiczne wykonanie, wystawienie, wyświetlenie, odtworzenie oraz nadawanie i reemitowanie, a także publiczne udostępnianie artykułu w taki sposób, aby każdy mógł mieć do niego dostęp w miejscu i w czasie przez siebie wybranym.
- Włączenie artykułu w skład utworu zbiorowego.
- Wprowadzanie artykułu w postaci elektronicznej na platformy elektroniczne lub inne wprowadzanie artykułu w postaci elektronicznej do Internetu, lub innej sieci.
- Rozpowszechnianie artykułu w postaci elektronicznej w internecie lub innej sieci, w pracy zbiorowej jak również samodzielnie.
- Udostępnianie artykułu w wersji elektronicznej w taki sposób, by każdy mógł mieć do niego dostęp w miejscu i czasie przez siebie wybranym, w szczególności za pośrednictwem Internetu.
Autorzy poprzez przesłanie wniosku o publikację:
- Wyrażają zgodę na publikację artykułu w czasopiśmie,
- Wyrażają zgodę na nadanie publikacji DOI (Digital Object Identifier),
- Zobowiązują się do przestrzegania kodeksu etycznego wydawnictwa zgodnego z wytycznymi Komitetu do spraw Etyki Publikacyjnej COPE (ang. Committee on Publication Ethics), (http://ihar.edu.pl/biblioteka_i_wydawnictwa.php),
- Wyrażają zgodę na udostępniane artykułu w formie elektronicznej na mocy licencji CC BY-SA 4.0, w otwartym dostępie (open access),
- Wyrażają zgodę na wysyłanie metadanych artykułu do komercyjnych i niekomercyjnych baz danych indeksujących czasopisma.
Inne teksty tego samego autora
- Joanna Wolko, Agnieszka Dobrzycka, Jan Bocianowski, Ocena efektu heterozji cech struktury plonu mieszańców pojedynczych i mieszańców trójliniowych rzepaku (Brassica napus L.) , Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin: Nr 287 (2019): Wydanie specjalne
- Jan Bocianowski, Henryk Brzeskwiniewicz, Tadeusz Łuczkiewicz, Wpływ doboru testerów na ocenę efektów GCA linii wsobnych rzepaku jarego , Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin: Nr 250 (2008): Wydanie regularne
- Katarzyna Ambroży, Ewa Bakinowska, Jan Bocianowski, Anna Budka, Wiesław Pilarczyk, Bogna Zawieja, Statystyczne wspomaganie decyzji selekcyjnych na wczesnych etapach hodowli zbóż. Część II. Empiryczne porównanie metod oceny efektów obiektowych , Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin: Nr 250 (2008): Wydanie regularne
- Wojciech Rybiński, Jan Bocianowski, Katarzyna Pankiewicz, Zróżnicowanie cech morfologicznych i plonotwórczych u indukowanych mutantów odmian lędźwianu siewnego (Lathyrus sativus L.) , Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin: Nr 249 (2008): Wydanie regularne
- Katarzyna Ambroży, Ewa Bakinowska, Jan Bocianowski, Anna Budka, Wiesław Pilarczyk, Bogna Zawieja, Statystyczne wspomaganie decyzji selekcyjnych na wczesnych etapach hodowli zbóż. Część I. Metody oceny efektów obiektowych , Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin: Nr 250 (2008): Wydanie regularne
- Wojciech Rybiński, Tadeusz Adamski, Maria Surma, Jan Bocianowski, Uzyskiwanie haploidów i ocena zmienności cech ilościowych linii dihaploidalnych jęczmienia jarego z wykorzystaniem metody Hordeum bulbosum i mutagenezy , Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin: Nr 275 (2015): Wydanie regularne
- Agnieszka Dobrzycka, Joanna Wolko, Jan Bocianowski, Kamila Nowosad, Charakterystyka zmienności fenotypowej linii DH oraz mieszańców rzepaku ozimego (Brassica napus L.) pod względem cech struktury plonu , Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin: Nr 287 (2019): Wydanie specjalne
- Anita Dobek, Jan Bocianowski, Ewa Bakinowska, Wiesław Pilarczyk, Wojciech Mikulski, Jacek Kaczmarek, Problemy związane z testowaniem linii i rodów zbóż na wczesnych etapach hodowli , Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin: Nr 249 (2008): Wydanie regularne
- Błażej Hernacki, Iwona Bartkowiak-Broda, Aleksandra Piotrowska, Teresa Cegielska-Taras, Rozważania nad mapowaniem genetycznym QTL odpowiedzialnym za cechę żółtonasienności rzepaku ozimego (Brassica napus L.) , Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin: Nr 253 (2009): Wydanie regularne
- Katarzyna Gacek, Iwona Bartkowiak-Broda, Laurencja Szala, Teresa Cegielska-Taras, Philipp E. Bayer, David Edwards, Jacqueline Batley, Steven Penfield, Identyfikacja genetycznych podstaw procesu kiełkowania w nasionach rzepaku (Brassica napus L.) z wykorzystaniem mapowania genetycznego , Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin: Nr 287 (2019): Wydanie specjalne