Identyfikacja genetycznych podstaw procesu kiełkowania w nasionach rzepaku (Brassica napus L.) z wykorzystaniem mapowania genetycznego
Katarzyna Gacek
kgacek@nico.ihar.poznan.plInstytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin — Państwowy Instytut Badawczy, Oddział w Poznaniu (Poland)
https://orcid.org/0000-0001-8621-8673
Iwona Bartkowiak-Broda
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin — Państwowy Instytut Badawczy, Oddział w Poznaniu (Poland)
https://orcid.org/0000-0002-4071-1849
Laurencja Szala
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin — Państwowy Instytut Badawczy, Oddział w Poznaniu (Poland)
https://orcid.org/0000-0001-9157-7638
Teresa Cegielska-Taras
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin — Państwowy Instytut Badawczy, Oddział w Poznaniu (Poland)
https://orcid.org/0000-0002-6002-9281
Philipp E. Bayer
School of Plant Biology, University of Western Australia, Perth, Crawley, Australia (Australia)
https://orcid.org/0000-0001-8530-3067
David Edwards
School of Plant Biology, University of Western Australia, Perth, Crawley, Australia (Australia)
https://orcid.org/0000-0002-9480-4936
Jacqueline Batley
School of Plant Biology, University of Western Australia, Perth, Crawley, Australia (Australia)
https://orcid.org/0000-0002-5391-5824
Steven Penfield
John Innes Centre, Norwich, UK (United Kingdom)
https://orcid.org/0000-0001-6340-1731
Abstrakt
Badano populację mapującą rzepaku ozimego złożoną z 78 linii podwojonych haploidów uzyskanych z mieszańców pochodzących ze skrzyżowania linii różniących się siłą kiełkowania. Siła kiełkowania nasion była automatycznie rejestrowana co 30 min przy pomocy aparatu fotograficznego umieszczonego w minikomputerze Raspberry Pi. Zdjęcia przeanalizowano przy pomocy oprogramowania stworzonego w John Innes Centre. W kolejnym etapie wykorzystując metodę sekwencjonowania całego genomu (Illumina® HiSeq) wszystkich linii populacji mapującej zidentyfikowano polimorfizmy pojedynczego nukleotydu (SNPs) w tych liniach. Dane te posłużą do mapowania genetycznego i identyfikacji genów regulujących proces kiełkowania.
Instytucje finansujące
Praca powstała w wyniku realizacji działania naukowego o nr 2017/01/X/NZ2/00113 finansowanego ze środków Narodowego Centrum Nauki.
Słowa kluczowe:
rzepak, mapowanie genetyczne, kiełkowanieGacek, K. . (2019) „Identyfikacja genetycznych podstaw procesu kiełkowania w nasionach rzepaku (Brassica napus L.) z wykorzystaniem mapowania genetycznego ”, Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin, (287), s. 23–24. doi: 10.37317/biul-2019-0100.
Autorzy
Katarzyna Gacekkgacek@nico.ihar.poznan.pl
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin — Państwowy Instytut Badawczy, Oddział w Poznaniu Poland
https://orcid.org/0000-0001-8621-8673
Autorzy
Iwona Bartkowiak-BrodaInstytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin — Państwowy Instytut Badawczy, Oddział w Poznaniu Poland
https://orcid.org/0000-0002-4071-1849
Autorzy
Laurencja SzalaInstytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin — Państwowy Instytut Badawczy, Oddział w Poznaniu Poland
https://orcid.org/0000-0001-9157-7638
Autorzy
Teresa Cegielska-TarasInstytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin — Państwowy Instytut Badawczy, Oddział w Poznaniu Poland
https://orcid.org/0000-0002-6002-9281
Autorzy
Philipp E. BayerSchool of Plant Biology, University of Western Australia, Perth, Crawley, Australia Australia
https://orcid.org/0000-0001-8530-3067
Autorzy
David EdwardsSchool of Plant Biology, University of Western Australia, Perth, Crawley, Australia Australia
https://orcid.org/0000-0002-9480-4936
Autorzy
Jacqueline BatleySchool of Plant Biology, University of Western Australia, Perth, Crawley, Australia Australia
https://orcid.org/0000-0002-5391-5824
Autorzy
Steven PenfieldJohn Innes Centre, Norwich, UK United Kingdom
https://orcid.org/0000-0001-6340-1731
Statystyki
Abstract views: 232PDF downloads: 162
Licencja
Utwór dostępny jest na licencji Creative Commons Uznanie autorstwa – Na tych samych warunkach 4.0 Miedzynarodowe.
Z chwilą przekazania artykułu, Autorzy udzielają Wydawcy niewyłącznej i nieodpłatnej licencji na korzystanie z artykułu przez czas nieokreślony na terytorium całego świata na następujących polach eksploatacji:
- Wytwarzanie i zwielokrotnianie określoną techniką egzemplarzy artykułu, w tym techniką drukarską oraz techniką cyfrową.
- Wprowadzanie do obrotu, użyczenie lub najem oryginału albo egzemplarzy artykułu.
- Publiczne wykonanie, wystawienie, wyświetlenie, odtworzenie oraz nadawanie i reemitowanie, a także publiczne udostępnianie artykułu w taki sposób, aby każdy mógł mieć do niego dostęp w miejscu i w czasie przez siebie wybranym.
- Włączenie artykułu w skład utworu zbiorowego.
- Wprowadzanie artykułu w postaci elektronicznej na platformy elektroniczne lub inne wprowadzanie artykułu w postaci elektronicznej do Internetu, lub innej sieci.
- Rozpowszechnianie artykułu w postaci elektronicznej w internecie lub innej sieci, w pracy zbiorowej jak również samodzielnie.
- Udostępnianie artykułu w wersji elektronicznej w taki sposób, by każdy mógł mieć do niego dostęp w miejscu i czasie przez siebie wybranym, w szczególności za pośrednictwem Internetu.
Autorzy poprzez przesłanie wniosku o publikację:
- Wyrażają zgodę na publikację artykułu w czasopiśmie,
- Wyrażają zgodę na nadanie publikacji DOI (Digital Object Identifier),
- Zobowiązują się do przestrzegania kodeksu etycznego wydawnictwa zgodnego z wytycznymi Komitetu do spraw Etyki Publikacyjnej COPE (ang. Committee on Publication Ethics), (http://ihar.edu.pl/biblioteka_i_wydawnictwa.php),
- Wyrażają zgodę na udostępniane artykułu w formie elektronicznej na mocy licencji CC BY-SA 4.0, w otwartym dostępie (open access),
- Wyrażają zgodę na wysyłanie metadanych artykułu do komercyjnych i niekomercyjnych baz danych indeksujących czasopisma.
Inne teksty tego samego autora
- Zygmunt Kaczmarek, Henryk Woś, Elżbieta Adamska, Tadeusz Adamski, Roman Biliński, Grzegorz Budzianowski, Łukasz Mańkowski, Ewelina Majchrzak, Janina Woś, Laurencja Szała, Teresa Cegielska-Taras, Renata Trzeciak, Ocena linii rodzicielskich rzepaku ozimego na podstawie plonu mieszańców z niekompletnego układu krzyżowania , Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin: Nr 277 (2015): Wydanie regularne
- Elżbieta Adamska, Zygmunt Kaczmarek, Laurencja Szała, Teresa Cegielska-Taras, Analiza zdolności kombinacyjnych linii DH rzepaku ozimego pod względem zawartości kwasów tłuszczowych , Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin: Nr 249 (2008): Wydanie regularne
