Identyfikacja odmian ziemniaka metodą elektroforetyczną
Włodzimierz Przewodowski
w.przewodowski@ihar.edu.plInstytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin w Radzikowie, Pracownia Diagnostyki Molekularnej i Biochemii, Zakładu Nasiennictwa i Ochrony Ziemniaka w Boninie (Poland)
Jerzy Lewosz
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin w Radzikowie, Pracownia Diagnostyki Molekularnej i Biochemii, Zakładu Nasiennictwa i Ochrony Ziemniaka w Boninie (Poland)
Krzysztof Treder
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin w Radzikowie, Pracownia Diagnostyki Molekularnej i Biochemii, Zakładu Nasiennictwa i Ochrony Ziemniaka w Boninie (Poland)
Agnieszka Barnyk
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin w Radzikowie, Pracownia Diagnostyki Molekularnej i Biochemii, Zakładu Nasiennictwa i Ochrony Ziemniaka w Boninie (Poland)
Tomasz Pilecki
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin w Radzikowie, Pracownia Diagnostyki Molekularnej i Biochemii, Zakładu Nasiennictwa i Ochrony Ziemniaka w Boninie (Poland)
Abstrakt
Identyfikację 92 odmian ziemniaka przeprowadzono z wykorzystaniem elektroforetycznej analizy składu białkowych inhibitorów proteaz wyizolowanych z bulw ziemniaka. Inhibitory proteaz stanowią grupę białek o specyficznym odmianowo składzie i mogą służyć jako biochemiczne markery odmian ziemniaka. Analizę elektroforetyczna tych białek wykonywano po ich oddzieleniu od pozostałych białek metodą chromatografii powinowactwa. W tym celu sporządzono kolumny chromatograficzne z trypsyną immobilizowaną na nośniku Sepharose. Sok bulw nanoszono na kolumny celem związania inhibitorów proteaz z immobilizowaną trypsyną w obojętnym pH, a po wymyciu niewiążących się białek, eluowano z kolumny białka inhibitorowe przez przemywanie kolumny roztworem buforu o pH 1,8. Roztwory tych białek po neutralizacji poddawano analizie elektroforetycznej w żelu poliakrylamidowym uzyskując rozdział poszczególnych form inhibitorów na pasma zależnie od wielkości, ładunku i kształtu cząstek. Układ tych pasm pozwala na odróżnienie odmian ziemniaka od siebie. Jako wewnętrznego markera ułatwiającego rozpoznawanie poszcze¬gólnych pasm i korygowania różnic między poszczególnymi żelami użyto inhibitorów proteaz wyizolowanych z odmiany Baszta.
Słowa kluczowe:
analiza elektroforetyczna, identyfikacja odmianowa, inhibitory trypsyny, markery biochemiczne, ziemniakBibliografia
Datta K., Usha R., Dutta S. K., Singh M. 2001. A comparative study of the winged bean protease inhibitors and their interaction with proteases. Plant Physiol. Biochem. 39: 949 — 959.
Google Scholar
Hou1 W. C., Huang D. J., Lin Y. H. 2002. An aspartic type protease degrades trypsin inhibitors, the major root storage proteins of sweet potato (Ipomoea batatas (L.) Lam cv. Tainong 57). Bot. Bull. Acad. Sin. 43: 271 — 276.
Google Scholar
Ishikowa A., Ohta S., Matsuoka K., Hattori T., Nahanura K. 1994. A family of potato genes that encode Kunitz-type proteinase inhibitors: structural comparisons and differential expression. Plant Cell Physiol. 35 (2): 303 — 312.
Google Scholar
Kaiser K. P., Bruhn L. C., Belitz H. D. 1974. Proteinase inhibitors in potatoes. Protein, trypsin and hymotrypsin inhibitor patterns by isoelectric focusing in polyacrylamide gel. A rapid method for identification of potato varieties. Z. Lobensum. Kuters. Forsch. 154: 339.
Google Scholar
Kłyszejko-Stefanowicz L. 2003. Ilościowe oznaczanie białka metodą mikrobiuretową. Ćwiczenia z biochemii, PWN, Warszawa: 248.
Google Scholar
Lam W., Coast G. M., Rayne R. C. 2000. Characterization of multiple trypsins from the midget of Locusta migratori. Insect Biochemistry and Molecular Biology 30: 85 — 94.
Google Scholar
Lewosz J., Ryś D., Reda S. 1981. Electrophoretic method for determination of molecular forms of trypsin inhibitors of potato tubers. Analytical Biochemistry 115: 27 — 29.
Google Scholar
Macedo M. L. R., de Matos D. G. G., Machado O. L. T., Marangoni., Novello J. C. 2000. Trypsin inhibitor from Dimorphandra mollis seeds: purification and properties. Phytochemistry 54: 553 — 558.
Google Scholar
Pilecka A., Lewosz J. 1999. Zastosowanie technik molekularnych do oceny jednorodności odmianowej ziemniaka. W: Ochrona ziemniaka. Konferencja. Kołobrzeg, 21–22.04.1999. IHAR Oddz. Bonin: 92 — 95.
Google Scholar
Reda S., Lewosz J., Hołubowska M., Budnik H. 1981. Identyfikacja odmian ziemniaka na podstawie elektroforetycznego obrazu inhibitorów trypsyny i białek bulw. Ziemniak 1981: 27 — 35
Google Scholar
Ryan C. A. 1990. Protease inhibitor in plants: genes for improving defenses against insects and pathogens. Annu. Rev. Phytopathol. 28: 425 — 449.
Google Scholar
Autorzy
Włodzimierz Przewodowskiw.przewodowski@ihar.edu.pl
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin w Radzikowie, Pracownia Diagnostyki Molekularnej i Biochemii, Zakładu Nasiennictwa i Ochrony Ziemniaka w Boninie Poland
Autorzy
Jerzy LewoszInstytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin w Radzikowie, Pracownia Diagnostyki Molekularnej i Biochemii, Zakładu Nasiennictwa i Ochrony Ziemniaka w Boninie Poland
Autorzy
Krzysztof TrederInstytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin w Radzikowie, Pracownia Diagnostyki Molekularnej i Biochemii, Zakładu Nasiennictwa i Ochrony Ziemniaka w Boninie Poland
Autorzy
Agnieszka BarnykInstytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin w Radzikowie, Pracownia Diagnostyki Molekularnej i Biochemii, Zakładu Nasiennictwa i Ochrony Ziemniaka w Boninie Poland
Autorzy
Tomasz PileckiInstytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin w Radzikowie, Pracownia Diagnostyki Molekularnej i Biochemii, Zakładu Nasiennictwa i Ochrony Ziemniaka w Boninie Poland
Statystyki
Abstract views: 44PDF downloads: 40
Licencja
Prawa autorskie (c) 2007 Włodzimierz Przewodowski, Jerzy Lewosz, Krzysztof Treder, Agnieszka Barnyk, Tomasz Pilecki
Utwór dostępny jest na licencji Creative Commons Uznanie autorstwa – Na tych samych warunkach 4.0 Miedzynarodowe.
Z chwilą przekazania artykułu, Autorzy udzielają Wydawcy niewyłącznej i nieodpłatnej licencji na korzystanie z artykułu przez czas nieokreślony na terytorium całego świata na następujących polach eksploatacji:
- Wytwarzanie i zwielokrotnianie określoną techniką egzemplarzy artykułu, w tym techniką drukarską oraz techniką cyfrową.
- Wprowadzanie do obrotu, użyczenie lub najem oryginału albo egzemplarzy artykułu.
- Publiczne wykonanie, wystawienie, wyświetlenie, odtworzenie oraz nadawanie i reemitowanie, a także publiczne udostępnianie artykułu w taki sposób, aby każdy mógł mieć do niego dostęp w miejscu i w czasie przez siebie wybranym.
- Włączenie artykułu w skład utworu zbiorowego.
- Wprowadzanie artykułu w postaci elektronicznej na platformy elektroniczne lub inne wprowadzanie artykułu w postaci elektronicznej do Internetu, lub innej sieci.
- Rozpowszechnianie artykułu w postaci elektronicznej w internecie lub innej sieci, w pracy zbiorowej jak również samodzielnie.
- Udostępnianie artykułu w wersji elektronicznej w taki sposób, by każdy mógł mieć do niego dostęp w miejscu i czasie przez siebie wybranym, w szczególności za pośrednictwem Internetu.
Autorzy poprzez przesłanie wniosku o publikację:
- Wyrażają zgodę na publikację artykułu w czasopiśmie,
- Wyrażają zgodę na nadanie publikacji DOI (Digital Object Identifier),
- Zobowiązują się do przestrzegania kodeksu etycznego wydawnictwa zgodnego z wytycznymi Komitetu do spraw Etyki Publikacyjnej COPE (ang. Committee on Publication Ethics), (http://ihar.edu.pl/biblioteka_i_wydawnictwa.php),
- Wyrażają zgodę na udostępniane artykułu w formie elektronicznej na mocy licencji CC BY-SA 4.0, w otwartym dostępie (open access),
- Wyrażają zgodę na wysyłanie metadanych artykułu do komercyjnych i niekomercyjnych baz danych indeksujących czasopisma.
Inne teksty tego samego autora
- Małgorzata Łabańska, Włodzimierz Przewodowski , Biosensory – nowoczesne narzędzia analityczne do detekcji patogenów roślinnych , Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin: Nr 290 (2020): Wydanie specjalne
- Dorota Michałowska, Agnieszka Przewodowska, Włodzimierz Przewodowski, Oksana Olejnik, Joanna Piskorz, Bank Genów Ziemniaka in vitro w Boninie , Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin: Nr 290 (2020): Wydanie specjalne
- dr hab. inż. Włodzimierz Przewodowski , Katarzyna Salamońska, Dorota Szarek, Dorota Michałowska, Wioleta Stochła, Agnieszka Przewodowska, Grzegorz Gryń, Milena Pietraszko, Katarzyna Franke, Badania nad opracowaniem metod selektywnej izolacji oraz czułej identyfikacji bakterii Clavibacter michiganensis ssp. sepedonicus w trudnych diagnostycznie próbach środowiskowych , Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin: Nr 286 (2019): Wydanie specjalne
- dr Krzysztof Treder , Mateusz Mielczarek, Anna Pawłowska, Bogumiła Zacharzewska, Maria Fedczak, Opracowanie czułych metod wykrywania najważniejszych wirusów ziemniaka , Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin: Nr 286 (2019): Wydanie specjalne
- dr Dominika Boguszewska-Mańkowska , Krystyna Zarzyńska , Krzysztof Treder , Bogumiła Zacharzewska , Badania tolerancji odmian ziemniaka na stresy abiotyczne w świetle postępujących zmian klimatycznych , Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin: Nr 286 (2019): Wydanie specjalne
- mgr inż. Dorota Michałowska , Agnieszka Przewodowska, Włodzimierz Przewodowski, Paulina Buryło , Eliminacja patogenów niekwarantannowych (bakterie endogenne i wirusy) oraz kontrola zdrowotności roślin ziemniaka w banku in vitro , Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin: Nr 286 (2019): Wydanie specjalne
- Agnieszka Barnyk, Jerzy Lewosz, Krzysztof Treder, Włodzimierz Przewodowski, Tomasz Pilecki, Zastosowanie chromatografii tiofilnej do izolacji przeciwciał poliklonalnych z surowicy krwi królików , Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin: Nr 248 (2008): Wydanie regularne
- Milena Pietraszko, Grzegorz Gryń, Teresa Pastuszewska, Włodzimierz Przewodowski, Agnieszka Przewodowska, Podatność wybranych odmian ziemniaka na porażenie bakteriami Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus w zróżnicowanych warunkach glebowych , Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin: Nr 277 (2015): Wydanie regularne
- Joanna Piskorz, Agnieszka Przewodowska, Dorota Michałowska, Krzysztof Treder, Identyfikacja odmian w kolekcji polowej ziemniaka tetraploidalnego , Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin: Nr 283 (2018): Wydanie specjalne
