Zastosowanie markerów ISSR do analizy wewnątrzgatunkowego podobieństwa genetycznego Avena sterilis L.

Edyta Paczos-Grzęda

edyta.paczos@up.lublin.pl
Instytut Genetyki i Hodowli i Biotechnologii Roślin, Uniwersytet Przyrodniczy w Lublinie (Poland)

Maria Chrząstek


Instytut Genetyki i Hodowli i Biotechnologii Roślin, Uniwersytet Przyrodniczy w Lublinie (Poland)

Sylwia Okoń


Instytut Genetyki i Hodowli i Biotechnologii Roślin, Uniwersytet Przyrodniczy w Lublinie (Poland)

Agnieszka Grądzielewska


Instytut Genetyki i Hodowli i Biotechnologii Roślin, Uniwersytet Przyrodniczy w Lublinie (Poland)

Danuta Miazga


Instytut Genetyki i Hodowli i Biotechnologii Roślin, Uniwersytet Przyrodniczy w Lublinie (Poland)

Abstrakt

W Instytucie Genetyki, Hodowli i Biotechnologii Roślin, Uniwersytetu Przyrodniczego w Lublinie prowadzony jest program obejmujący krzyżowanie owsa zwyczajnego z dzikimi gatunkami z rodzaju Avena L. W krzyżowaniach jako formy mateczne wykorzystywane są polskie i amerykań¬skie odmiany owsa oraz linie hodowlane. Komponentami ojcowskimi są dzikie gatunki heksaploidalne: A. sterilis L. i A. fatua L. oraz tetraploidalne: A. murphyi Ladiz. i A. maroccana Gdgr. W celu określenia poziomu zróżnicowania genetycznego form A. sterilis wykorzystywanych do krzyżowań przeprowadzono analizę polimorfizmu markerów ISSR. Metoda ISSR jest wysoce efektywna, identyfikuje wysoki polimorfizm i może być z powodzeniem stosowana do oceny zróżnicowania genetycznego w obrębie Avena sterilis L. Podobieństwo genetyczne analizowanych genotypów określone na podstawie polimorfizmu markerów ISSR wahało się od 0,512 pomiędzy AVE 2532 i AVE 2116 do 0,878 pomiędzy CN 26025 i AVE 531, a średnio wynosiło 0,715. Takie wartości współczynników podobieństwa genetycznego świadczą o dużym zróżnicowaniu genotypów A. sterilis przeznaczonych do krzyżowań.


Słowa kluczowe:

Avena sterilis L., ISSR, podobieństwo genetyczne

Chrząstek M., Paczos-Grzęda E., Kowalczyk K., Miazga D., Kruk K. 2006. Mieszańce międzygatunkowe owsa. W: Mieszańce oddalone roślin uprawnych. Sodkiewicz W., Sodkiewicz T., Surma M. (red.). IGR PAN Poznań: 49 — 62.
Google Scholar

Chrząstek M., Paczos-Grzęda E., Miazga D. 2004. Charakterystyka cytologiczna i molekularna niektórych gatunków z rodzaju Avena W: Genetyka w ulepszaniu roślin użytkowych. Red. P. Krajewski, Z. Zwierzykowski, P. Kachlicki. IGR PAN Poznań: 67 — 74.
Google Scholar

Cox T. S., Murphy J. P. 1990. The effect of parental divergence on F2 heterosis in winter wheat crosses. Theor. Appl. Genet. 79: 241 — 250.
Google Scholar

De Souza V. Q., Pereira A. Da S., Kopp M. M., Coimbra J. L. M., De Carvalho F. I. F., Da Luz V. K., De Oliveira A. C. 2005. Genetic dissimilarity in oat (Avena sativa L.) tolerant and sensitive mutants to organic acids. Bragantia 64: 569 — 575.
Google Scholar

Frey K. J. 1986. Genetic resources and their use in oat breeding. In: Proc. of the 2nd Int. Oat Conf. 1985. Lawes D. A., Thomas H. (red.). Aberystwyth, UK: 9 — 15.
Google Scholar

Fu Y.-B., Chong J., Fetch T., Wang M.-L. 2007. Microsatellite variation in Avena sterilis oat germplasm. Theor. Appl. Genet. 114: 1029 –1038.
Google Scholar

Goffreda J. C., Barnquist W. B., Beer S. C., Tanksley S. D., Sorrels M. E. 1992. Application of molecular markers to assess genetic relationships among accessions of wild oat, Avena sterilis. Theor. Appl. Genet. 85: 146 — 151.
Google Scholar

Graham J., McNicol R. J., McNicol J. W. 1996. A comparison of methods for estimation of genetic diversity in strawberry cultivars. Theor. Appl. Genet. 93: 402 — 406.
Google Scholar

Heun M., Murphy J. P., Phillips T. D. 1994. A comparison of RAPD and isozyme analyses for determining the genetic relationships among Avena sterilis L. accessions. Theor. Appl. Genet. 87: 689 — 696.
Google Scholar

Li C. D., Rossnagel B. G., Scoles G. J. 2000. The development of oat microsatellite markers and their use in identifying relationships among Avena species and oat cultivars. Theor. Appl. Genet. 93: 869 — 876.
Google Scholar

Martens J. W., McKenzie R. I. H., Harder D. E. 1980. Resistance to Puccinia gramminis avenae and P. coronata avenae in the wild and cultivated Avena populations of Iran, Iraq, and Turkey. Can. J. Genet. Cytol. 22: 641 — 649.
Google Scholar

Milligan B. G. 1992. Plant DNA isolation. In: Molecular analysis of populations: a practical approach. IRL Press, Oxford, UK: 59 — 88.
Google Scholar

Nei M., Li W. H. 1979. Mathematical model for studying genetic variation in terms of restriction endonucleases. Proc. Natl. Acad. Sci. 76: 5269 — 5273.
Google Scholar

Paczos-Grzęda E., Chrząstek M., Miazga D., Wacko S. 2006. Analiza molekularna mieszańców Avena sativa L. × A. maroccana Gdgr oraz A. sativa L. × A. murphyi Ladiz. W: Mieszańce oddalone roślin uprawnych. Sodkiewicz W., Sodkiewicz T., Surma M. (red.), IGR PAN Poznań: 135 — 141.
Google Scholar

Paczos-Grzęda E. 2007. Wykorzystanie metod ISSR i RAPD oraz analizy rodowodów do oceny podobieństwa międzyodmianowego Avena sativa L. Zeszyty Problemowe Postępów Nauk Rolniczych 517: 547 — 558.
Google Scholar

Pejic I., Ajmone-Marsan P., Morgante M., Kozumplicck V., Castiglioni P., Taramino G., Motto M. 1998. Comparative analysis of genetic similarity among maize inbred lines detected by RFLPs, RAPDs, SSRs, and AFLPs. Theor. Appl. Genet. 97: 248 — 1255.
Google Scholar

Phillips T. D., Murphy J. P. Goodman M. M. 1993. Isozyme variation in germplasm accessions of the wild oat Avena sterilis L. Theor. Appl. Genet. 86 (1): 54 — 64.
Google Scholar

Powell W., Morgante M., Andre C., Hanafey M., Vogel J., Tingey S., Rafalski A. 1996. Comparison of RFLP, RAPD, AFLP and SSR (microsatellite) markers for germplasm analysis. Mol. Breed. 2: 225 — 238.
Google Scholar

Predeep-Reddy M., Salara N., Siddiq E. A. 2002. Inter simple sequence repeat (ISSR) polymorphism and its application in plant breeding. Euphytica 128: 9 — 17.
Google Scholar

Rivoal R., Cook R. 1993. Plant parasitic nematodes in temperate agriculture. In: K. Evans and J. M. Webster (ed.). CAB International, Wallingford, UK: 259 — 303.
Google Scholar

Rohlf F.J. 2001. NTSYS-pc numerical taxonomy and multivariate analysis system. Version 5.1.Exeter Publishing Ltd., Setauket, N.Y.
Google Scholar

Somody C. N., Nalewaja J. D., Miller S. D. 1984. Wild oat (Avena fatua) and Avena sterilis morphological characteristic and response to herbicides. Weed. Sci. 32: 353 — 359.
Google Scholar

Spada A., Mantegazza R., Biloni M., Caporali E., Sala F. 2004. Italian rice varieties: historical data, molecular markers and pedigrees to reveal their genetic relationships. Plant Breeding 123: 105 — 111.
Google Scholar

Takeda, K. Frey, K. J. 1977. Growth rate inheritance and association with other traits in backcross populations of Avena sterilis × A.sativa. Euphytica 26: 309 — 317.
Google Scholar

Tanhuanpaa P., Kalendar R., Laurila J., Schulman A. H., Manninen O., Kiviharju E. 2006. Generation of SNP markers for short straw in oat (Avena sativa L.). Genome 49: 282 — 287.
Google Scholar

Tanhuanpaa P., Kalendar R., Schulman A. H., Kiviharju E. 2008. The first doubled haploid linkage map for cultivated oat. Genome 51 (8): 560 — 569.
Google Scholar

Thro A. M., Frey K. J. 1985. Inheritance of groat — oil content and high-oil selection in oats (Avena sativa L.). Euphytica 34: 251 — 263.
Google Scholar

Zhou X., Jellen E.N., Murphy J.P. 1999. Progenitor germplasm of domesticated hexaploid oat. Crop Sci. 39: 1208 — 1214.
Google Scholar

Ziętkiewicz E., Rafalski A., Labuda D. 1994. Genome fingerprinting by simple-sequence repeat (SSR)-anchored polymerase chain reaction amplification. Genomics 20: 176 — 183.
Google Scholar

Pobierz


Opublikowane
06/30/2009

Cited By / Share

Paczos-Grzęda, E. (2009) „Zastosowanie markerów ISSR do analizy wewnątrzgatunkowego podobieństwa genetycznego Avena sterilis L. ”, Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin, (252), s. 215–223. doi: 10.37317/biul-2009-0069.

Autorzy

Edyta Paczos-Grzęda 
edyta.paczos@up.lublin.pl
Instytut Genetyki i Hodowli i Biotechnologii Roślin, Uniwersytet Przyrodniczy w Lublinie Poland

Autorzy

Maria Chrząstek 

Instytut Genetyki i Hodowli i Biotechnologii Roślin, Uniwersytet Przyrodniczy w Lublinie Poland

Autorzy

Sylwia Okoń 

Instytut Genetyki i Hodowli i Biotechnologii Roślin, Uniwersytet Przyrodniczy w Lublinie Poland

Autorzy

Agnieszka Grądzielewska 

Instytut Genetyki i Hodowli i Biotechnologii Roślin, Uniwersytet Przyrodniczy w Lublinie Poland

Autorzy

Danuta Miazga 

Instytut Genetyki i Hodowli i Biotechnologii Roślin, Uniwersytet Przyrodniczy w Lublinie Poland

Statystyki

Abstract views: 32
PDF downloads: 63


Licencja

Prawa autorskie (c) 2009 Edyta Paczos-Grzęda, Maria Chrząstek, Sylwia Okoń, Agnieszka Grądzielewska, Danuta Miazga

Creative Commons License

Utwór dostępny jest na licencji Creative Commons Uznanie autorstwa – Na tych samych warunkach 4.0 Miedzynarodowe.

Z chwilą przekazania artykułu, Autorzy udzielają Wydawcy niewyłącznej i nieodpłatnej licencji na korzystanie z artykułu przez czas nieokreślony na terytorium całego świata na następujących polach eksploatacji:

  1. Wytwarzanie i zwielokrotnianie określoną techniką egzemplarzy artykułu, w tym techniką drukarską oraz techniką cyfrową.
  2. Wprowadzanie do obrotu, użyczenie lub najem oryginału albo egzemplarzy artykułu.
  3. Publiczne wykonanie, wystawienie, wyświetlenie, odtworzenie oraz nadawanie i reemitowanie, a także publiczne udostępnianie artykułu w taki sposób, aby każdy mógł mieć do niego dostęp w miejscu i w czasie przez siebie wybranym.
  4. Włączenie artykułu w skład utworu zbiorowego.
  5. Wprowadzanie artykułu w postaci elektronicznej na platformy elektroniczne lub inne wprowadzanie artykułu w postaci elektronicznej do Internetu, lub innej sieci.
  6. Rozpowszechnianie artykułu w postaci elektronicznej w internecie lub innej sieci, w pracy zbiorowej jak również samodzielnie.
  7. Udostępnianie artykułu w wersji elektronicznej w taki sposób, by każdy mógł mieć do niego dostęp w miejscu i czasie przez siebie wybranym, w szczególności za pośrednictwem Internetu.

Autorzy poprzez przesłanie wniosku o publikację:

  1. Wyrażają zgodę na publikację artykułu w czasopiśmie,
  2. Wyrażają zgodę na nadanie publikacji DOI (Digital Object Identifier),
  3. Zobowiązują się do przestrzegania kodeksu etycznego wydawnictwa zgodnego z wytycznymi Komitetu do spraw Etyki Publikacyjnej COPE (ang. Committee on Publication Ethics), (http://ihar.edu.pl/biblioteka_i_wydawnictwa.php),
  4. Wyrażają zgodę na udostępniane artykułu w formie elektronicznej na mocy licencji CC BY-SA 4.0, w otwartym dostępie (open access),
  5. Wyrażają zgodę na wysyłanie metadanych artykułu do komercyjnych i niekomercyjnych baz danych indeksujących czasopisma.