Wykorzystanie markerów RAPD do oceny zróżnicowania genotypowego polskich odmian pszenżyta ozimego
Aneta Kramek
aneta.kramek@up.lublin.plInstytut Genetyki, Hodowli i Biotechnologii Roślin, Uniwersytet Przyrodniczy w Lublinie (Poland)
Abstrakt
Celem pracy była ocena zróżnicowania genotypowego 22 polskich odmian pszenżyta ozimego za pomocą markerów RAPD. Ocenę polimorfizmu międzyodmianowego przeprowadzono w oparciu o 15 starterów RAPD, które zostały wyselekcjonowane spośród 48 wstępnie testowanych na pięciu genotypach pszenżyta ozimego. Wybrane oligonukleotydy amplifikowały łącznie 135 fragmentów DNA, z których 87 (64,44%) było polimorficznych. Wartość indeksów podobieństwa genetycznego wynosiła średnio 0,862 i wahała się od 0,734 pomiędzy odmianami Malno i Tewo do 0,903 między odmianami Marko i Fidelio. Największy dystans genetyczny w stosunku do pozostałych odmian stwierdzono u odmiany Tewo (0,785), a najbardziej podobną do wszystkich odmian okazała się odmiana Fidelio (0,855). Na podstawie przeprowadzonych badań stwierdzono niewielkie zróżnicowanie genotypowe analizowanych odmian pszenżyta ozimego.
Słowa kluczowe:
markery RAPD, pszenżyto, zróżnicowanie genotypoweBibliografia
Broda Z. 2000. Diagnostyka molekularna w badaniach zmienności genetycznej roślin. Hod. Rośl. Nasien. 4: 36 — 37.
Google Scholar
Broda Z., Wojciechowska A. 2004. Przyszłość hodowli roślin w diagnostyce molekularnej. Hod. Rośl. Nasien. 2: 2 — 4.
Google Scholar
González J.M., Jouve N., Gustafson J. P., Muńiz L. M. 2002. A genetic map of molecular markers in × Triticosecale Wittmack. In: Proc. of the 5th Int. Triticale Symp., IHAR Radzików, Poland, 30 June — 5 July 2002, vol. II: 85 — 93.
Google Scholar
Iqbal J. M., Aziz N., Saeed N. A., Zafar Y. 1997. Genetic diversity evaluation of some elite cotton varieties by RAPD analysis. Theor. Appl. Genet. 94: 139 — 144.
Google Scholar
Lista Odmian Roślin Uprawnych, COBORU, Słupia Wielka: 1982–2003.
Google Scholar
Masojć P. 2000. Identyfikacja odmian pszenżyta przy użyciu markerów RAPD. Folia Univ. Agric. Stetin., Agricultura 206 (82): 179 — 184.
Google Scholar
Milczarski P., Banek-Tabor A., Masojć P. 2001. Wykorzystanie markerów RAPD do identyfikacji odmian pszenżyta. Biul. IHAR 218/219: 261 — 267.
Google Scholar
Milligan B.G. 1992. Molecular analysis of populations: a practical approach. Plant DNA isolation. IRL Press, Oxford, UK: 59 — 88.
Google Scholar
Nei M., Li W. H. 1979. Mathematical model for studying genetic variation in terms of restriction endonucleases. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 76: 5269 — 5273.
Google Scholar
Rohlf F. J. 2001. NTSYS-pc numerical taxonomy and multivariate analysis system. Version 2.10q. Exeter Publishing Ltd., Setauket, N.Y: 171.
Google Scholar
Schut J.W., Qi X., Stam P. 1997. Association between relationship measures based on AFLP markers, pedigree data and morphological traits in barley. Theor. Appl. Genet. 95: 1161 — 1168.
Google Scholar
Stojałowski S., Góral H. 2002. Wykorzystanie markerów RAPD i ISSR do różnicowania linii CMS pszenżyta ozimego z cytoplazmą T. timopheevi. Folia Univ. Agric. Stetin., Agricultura 228 (91): 161 — 166.
Google Scholar
Tams S. H., Bauer E., Oettler G., Melchinger A. E. 2004. Genetic diversity in European winter triticale determined with SSR markers and coancestry coefficient. Theor. Appl. Genet. 108: 1385 — 1391.
Google Scholar
Tams S. H., Melchinger A. E., Bauer E. 2005. Genetic similarity among European winter triticale elite germplasm assessed with AFLP and comparisons with SSR and pedigree data. Plant Breed. 124: 154 — 160.
Google Scholar
Tams S. H., Melchinger A. E., Oettler G., Bauer E. 2002. Assessment of genetic diversity in European winter triticale using molecular markers and pedigree data. In: Proc. of the 5th Int. Triticale Symp., IHAR Radzików, Poland, 30 June –— 5 July. vol. I: 95 — 103.
Google Scholar
Terzi V. 1998. RAPD markers for fingerprinting barley, oat and triticale varieties. J. Genet. Breed. 51(2): 115 — 120.
Google Scholar
Twardowska M., Banek-Tabor A., Masojć P. 2002. Identyfikacja odmian pszenżyta ozimego przy użyciu techniki RAPD. Folia Univ. Agric. Stetin., Agricultura 228 (91): 175 — 178.
Google Scholar
Tyrka M., Kociuba W. 2002. Ocena zróżnicowania genetycznego odmian pszenżyta ozimego 6x za pomocą zmodyfikowanej metody AFLP. Folia Univ. Agric. Stetin., Agricultura 228 (91): 185 — 190.
Google Scholar
Williams J. G. K., Kubelik A. R., Livak K. J., Rafalski J. A., Tingey S. V. 1990. DNA polymorphisms amplified by arbitrary primers are useful as genetic markers. Nucl. Acids. Res. 18: 6531 — 6535.
Google Scholar
Wolko B., Bartkowiak-Broda I. 1997. Metody diagnostyki molekularnej w hodowli roślin [in: Hodowla roślin. Materiały z I Krajowej Konferencji], Poznań, 19–20 listopada 1997: 389 — 402.
Google Scholar
Autorzy
Aneta Kramekaneta.kramek@up.lublin.pl
Instytut Genetyki, Hodowli i Biotechnologii Roślin, Uniwersytet Przyrodniczy w Lublinie Poland
Statystyki
Abstract views: 19PDF downloads: 24
Licencja
Prawa autorskie (c) 2008 Aneta Kramek
Utwór dostępny jest na licencji Creative Commons Uznanie autorstwa – Na tych samych warunkach 4.0 Miedzynarodowe.
Z chwilą przekazania artykułu, Autorzy udzielają Wydawcy niewyłącznej i nieodpłatnej licencji na korzystanie z artykułu przez czas nieokreślony na terytorium całego świata na następujących polach eksploatacji:
- Wytwarzanie i zwielokrotnianie określoną techniką egzemplarzy artykułu, w tym techniką drukarską oraz techniką cyfrową.
- Wprowadzanie do obrotu, użyczenie lub najem oryginału albo egzemplarzy artykułu.
- Publiczne wykonanie, wystawienie, wyświetlenie, odtworzenie oraz nadawanie i reemitowanie, a także publiczne udostępnianie artykułu w taki sposób, aby każdy mógł mieć do niego dostęp w miejscu i w czasie przez siebie wybranym.
- Włączenie artykułu w skład utworu zbiorowego.
- Wprowadzanie artykułu w postaci elektronicznej na platformy elektroniczne lub inne wprowadzanie artykułu w postaci elektronicznej do Internetu, lub innej sieci.
- Rozpowszechnianie artykułu w postaci elektronicznej w internecie lub innej sieci, w pracy zbiorowej jak również samodzielnie.
- Udostępnianie artykułu w wersji elektronicznej w taki sposób, by każdy mógł mieć do niego dostęp w miejscu i czasie przez siebie wybranym, w szczególności za pośrednictwem Internetu.
Autorzy poprzez przesłanie wniosku o publikację:
- Wyrażają zgodę na publikację artykułu w czasopiśmie,
- Wyrażają zgodę na nadanie publikacji DOI (Digital Object Identifier),
- Zobowiązują się do przestrzegania kodeksu etycznego wydawnictwa zgodnego z wytycznymi Komitetu do spraw Etyki Publikacyjnej COPE (ang. Committee on Publication Ethics), (http://ihar.edu.pl/biblioteka_i_wydawnictwa.php),
- Wyrażają zgodę na udostępniane artykułu w formie elektronicznej na mocy licencji CC BY-SA 4.0, w otwartym dostępie (open access),
- Wyrażają zgodę na wysyłanie metadanych artykułu do komercyjnych i niekomercyjnych baz danych indeksujących czasopisma.
Inne teksty tego samego autora
- Wanda Kociuba, Aneta Kramek, Krzysztof Ukalski, Ocena stabilności wybranych cech plonotwórczych polskich odmian pszenżyta ozimego , Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin: Nr 264 (2012): Wydanie regularne
- Roman Prażak, Wanda Kociuba, Zbigniew Segit, Aneta Kramek, Ocena tolerancji wybranych genotypów jarej pszenicy twardej (Triticum durum Desf.) na stres solny , Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin: Nr 283 (2018): Wydanie specjalne
- Wanda Kociuba, Aneta Kramek, Wewnątrzodmianowa zmienność cech użytkowych polskich odmian pszenżyta ozimego , Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin: Nr 249 (2008): Wydanie regularne
- Aneta Kramek, Krystyna Szwed-Urbaś, Zbigniew Segit, Ocena zmienności i współzależności cech ilościowych w kolekcji jarej pszenicy twardej pochodzenia afgańskiego , Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin: Nr 264 (2012): Wydanie regularne
- Wanda Kociuba, Aneta Kramek, Wartość mieszańców pszenżyta ozimego z pszenicą pod względem cech plonotwórczych oraz zawartości białka w ziarnie , Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin: Nr 253 (2009): Wydanie regularne
- Aneta Kramek, Wanda Kociuba, Jacek Gawroński, Wartość nowych odmian pszenżyta ozimego w porównaniu do regenerowanych materiałów kolekcyjnych , Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin: Nr 283 (2018): Wydanie specjalne
