Zastosowanie markerów SSR do testowania genetycznego zróżnicowania genotypów jęczmienia o różnej wrażliwości na fuzariozę kłosa
Ivana Ježíšková
int.office@mendelu.czMendel University of Agriculture and Forestry in Brno, Czech Republic (Czechia)
Jan Bednář
Mendel University of Agriculture and Forestry in Brno, Czech Republic (Czechia)
Hana Nevimová
Mendel University of Agriculture and Forestry in Brno, Czech Republic (Czechia)
Vlasta Wegscheiderová
Mendel University of Agriculture and Forestry in Brno, Czech Republic (Czechia)
Abstrakt
Fuzarioza kłosa (FHB) jest groźną chorobą zbóż szeroko rozpowszechnioną na całym świecie, wywoływaną przez grzyby z rodzaju Fusarium (F. culmorum, F. graminearum i in.). Porażenie jęczmienia tą chorobą może powodować nie tylko obniżkę plonu ale i akumulację w ziarnie niebezpiecznych wtórnych metabolitów grzyba — mykotoksyn (np. deoksyniwalenolu — DON). Nagromadzone mykotoksyny niekorzystnie wpływają na bezpieczeństwo żywności i obniżają jakość technologiczną ziarna. Celem badań było przetestowanie obecności markerów mikrosatelitarnych SSR (prostych powtórzonych sekwencji DNA) w siedmiu genotypach jęczmienia jarego (z określoną odpornością lub wrażliwością na FHB). Zbadano następujące formy: Chevron, Zao Zhou 3, PEC210, CI4196, 6NDRFG-1 (genotypy odporne) oraz PI383933 i Foster (genotypy wrażliwe). Wyniki zostaną wykorzystane do testowania 22 linii DH wytworzonych po skrzyżowaniu ww. genotypów w kombinacjach odporny × wrażliwy. Dotychczas przebadano genotypy rodzicielskie przy użyciu 35 markerów SSR z ogólnej liczby wybranych 60; 29 z tych markerów wykazało polimorfizm. Pozostałych sześć było monomorficznych i nie znajdą one zastosowania przy testowaniu linii DH. Częściowe wyniki analiz opracowano w formie binarnej macierzy i przekształcono w dendrogram charakteryzujący podobieństwo genetyczne analizowanych genotypów.
Instytucje finansujące
Słowa kluczowe:
FHB, SSR, Fuzarioza kłosa, jęczmień, mikrosatelityBibliografia
Armstrong K., Ho K. M., Fedak G., Martin R., Butler G., Savard M., Xue A., Langille L., Sabo F., Kuc M., Burville M. 2001. A study to identify molecular markers for Fusarium Head Blight in six-row barley. In: Proc 2nd Canadian Workshop on Fusarium head blight, 3–5 November 2001: 22 — 25.
Google Scholar
Cappetini F., Rasmusson D. C., Dill-Macky R., Schiefelbein E., Elakkad A. 2003. Inheritance of resistance to Fusarium Head Blight in four population of barley. Crop. Sci. 43: 1960 — 1966.
DOI: https://doi.org/10.2135/cropsci2003.1960
Google Scholar
Kolb F. L., Bai G. H., Muehlbauer G. J., Anderson J. A., Smith K. P., Fedak G. 2001. Host plant resistance genes for Fusarium Head Blight: mapping and manipulation with molecular markers. Crop Sci. 41: 611 — 619.
DOI: https://doi.org/10.2135/cropsci2001.413611x
Google Scholar
Heta H., Hiura U. 1963. Varietal differences in resistance to head blight, Giberella zeae (Schw.) Pech. Studies on the disease-resistance in barley. XIII. Nogaku Kenkyu 49: 177 — 187.
Google Scholar
Mueller U. G., Wolfenbarger L. L. 1999. AFLP genotyping and fingerprinting. Trends in Ecology and Evolution, 14, 10: 389 — 394.
DOI: https://doi.org/10.1016/S0169-5347(99)01659-6
Google Scholar
Takeda K., Heta H. 1989. Establishing the testing method and a search for the resistant varieties to Fusarium Head Blight in barley. Jpn. J. Breed. 40: 203 — 216.
DOI: https://doi.org/10.1270/jsbbs1951.39.203
Google Scholar
Steffenson B. J. 2003. Fusarium Head Blight: Impact, epidemics, management and strategies for identifying and utilizing genetic resistance. In: Leonard, K. J. and Bushnell, W. R. (ed): Fusarium Head Blight of wheat and barley, APS Press, St. Paul, Minnesota, USA: 241 — 296.
Google Scholar
Zhu Z., Cao W., Lu W., Fedak G., Armstrong K. 2001. Identification of AFLP marker for Fusarium Head Blight resistance in wheat. In: Proc 2nd Canadian Workshop on Fusarium Head Blight, 3–5 November 2001: 44 — 45.
Google Scholar
Autorzy
Ivana Ježíškováint.office@mendelu.cz
Mendel University of Agriculture and Forestry in Brno, Czech Republic Czechia
Autorzy
Jan BednářMendel University of Agriculture and Forestry in Brno, Czech Republic Czechia
Autorzy
Hana NevimováMendel University of Agriculture and Forestry in Brno, Czech Republic Czechia
Autorzy
Vlasta WegscheiderováMendel University of Agriculture and Forestry in Brno, Czech Republic Czechia
Statystyki
Abstract views: 12PDF downloads: 7
Licencja
Prawa autorskie (c) 2006 Ivana Ježíšková, Jan Bednář, Hana Nevimová, Vlasta Wegscheiderová
Utwór dostępny jest na licencji Creative Commons Uznanie autorstwa – Na tych samych warunkach 4.0 Miedzynarodowe.
Z chwilą przekazania artykułu, Autorzy udzielają Wydawcy niewyłącznej i nieodpłatnej licencji na korzystanie z artykułu przez czas nieokreślony na terytorium całego świata na następujących polach eksploatacji:
- Wytwarzanie i zwielokrotnianie określoną techniką egzemplarzy artykułu, w tym techniką drukarską oraz techniką cyfrową.
- Wprowadzanie do obrotu, użyczenie lub najem oryginału albo egzemplarzy artykułu.
- Publiczne wykonanie, wystawienie, wyświetlenie, odtworzenie oraz nadawanie i reemitowanie, a także publiczne udostępnianie artykułu w taki sposób, aby każdy mógł mieć do niego dostęp w miejscu i w czasie przez siebie wybranym.
- Włączenie artykułu w skład utworu zbiorowego.
- Wprowadzanie artykułu w postaci elektronicznej na platformy elektroniczne lub inne wprowadzanie artykułu w postaci elektronicznej do Internetu, lub innej sieci.
- Rozpowszechnianie artykułu w postaci elektronicznej w internecie lub innej sieci, w pracy zbiorowej jak również samodzielnie.
- Udostępnianie artykułu w wersji elektronicznej w taki sposób, by każdy mógł mieć do niego dostęp w miejscu i czasie przez siebie wybranym, w szczególności za pośrednictwem Internetu.
Autorzy poprzez przesłanie wniosku o publikację:
- Wyrażają zgodę na publikację artykułu w czasopiśmie,
- Wyrażają zgodę na nadanie publikacji DOI (Digital Object Identifier),
- Zobowiązują się do przestrzegania kodeksu etycznego wydawnictwa zgodnego z wytycznymi Komitetu do spraw Etyki Publikacyjnej COPE (ang. Committee on Publication Ethics), (http://ihar.edu.pl/biblioteka_i_wydawnictwa.php),
- Wyrażają zgodę na udostępniane artykułu w formie elektronicznej na mocy licencji CC BY-SA 4.0, w otwartym dostępie (open access),
- Wyrażają zgodę na wysyłanie metadanych artykułu do komercyjnych i niekomercyjnych baz danych indeksujących czasopisma.
Inne teksty tego samego autora
- Tomáš Vyhnánek , Jan Bednář , Władysław Kadłubiec, Polimorfizm białek zapasowych ziarna w odmianach pszenżyta wpisanych do rejestru w Republice Czech , Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin: Nr 240/241 (2006): Wydanie regularne
