Zastosowanie markerów RAPD do określenia podobieństwa genetycznego odmian jęczmienia ozimego (Hordeum vulgare L.)
Anetta Kuczyńska
office@igr.poznan.plInstytut Genetyki Roślin Polskiej Akademii Nauk w Poznaniu (Poland)
Jan Bocianowski
Instytut Genetyki Roślin Polskiej Akademii Nauk w Poznaniu (Poland)
Piotr Masojć
Akademia Rolnicza, Szczecin (Poland)
Maria Surma
Instytut Genetyki Roślin Polskiej Akademii Nauk w Poznaniu (Poland)
Tadeusz Adamski
Instytut Genetyki Roślin Polskiej Akademii Nauk w Poznaniu (Poland)
Abstrakt
Celem pracy było zbadanie zróżnicowania odmian jęczmienia ozimego na poziomie molekularnym. Materiał do badań stanowiło osiem odmian: Marinka, Gil, Tramp, Kroton, Tiffany, Horus, Kos oraz Sigra. Realizując cel pracy przeprowadzono reakcje RAPD-PCR dla 24 10-nukleotydowych starterów, wybranych wcześniej spośród 300 o losowej sekwencji. W wyniku reakcji otrzymano 172 zamplifikowane fragmenty DNA, z których 115 wykazywało polimorfizm. Obliczono współczynniki podobieństwa genetycznego według Nei’a, które posłużyły do hierarchicznego pogrupowania odmian. Wyniki grupowania przedstawiono w postaci dendrogramu. Największe podobieństwo wykazały pary Tiffany i Horus oraz Marinka i Kos, natomiast najmniej podobne okazały się Kroton i Tiffany oraz Kroton i Sigra.
Słowa kluczowe:
hierarchiczne grupowanie, jęczmień, podobieństwo genetyczne, RAPDBibliografia
Barua U. M., Chalmers K. J., Hackett C. A., Thomas W. T. B., Powell W., Waugh R. 1993. Identification of RAPD markers linked to a Rhynchosporium secalis resistance locus in barley using near-isogenic lines and bulked segregant analysis. Heredity 71: 177 — 184.
DOI: https://doi.org/10.1038/hdy.1993.122
Google Scholar
Bustos De A., Casanova C., Soler C., Jouve N. 1998. RAPD variation in wild populations of four species of the genus Hordeum (Poaceae). Theor. Appl. Genet. 96: 101 — 111.
DOI: https://doi.org/10.1007/s001220050715
Google Scholar
Hang A., Burton C. S., Hoffman D. L., Jones B. L. 2000. Random amplified polymorphic primer-generated embryo DNA polymorphisms among 16 North American malting barley cultivars. J. Am. Soc. Brew. Chem. 58 (4): 147 — 151.
DOI: https://doi.org/10.1094/ASBCJ-58-0147
Google Scholar
Kuczyńska A., Milczarski P., Surma M., Masojć P., Adamski T. 2001. Genetic diversity among cultivars of spring barley revealed by random amplified polymorphic DNA (RAPD). J. Appl. Genet. 42 (1): 43 — 48.
Google Scholar
Marczewski W. 1995. Markery molekularne w genetyce i hodowli roślin. Postępy Biochemii 41 (4): 237 — 243.
Google Scholar
Nei M., Li W. H. 1979. Mathematical model for studying genetic variation in terms of restriction. Proceedings of the Academy of Sciences of the USA 76: 5269 — 5273.
DOI: https://doi.org/10.1073/pnas.76.10.5269
Google Scholar
Przyborowski J. A., Weeden N. F. 2001. RAPD-based assessment of genetic similarity and distance between Lupinus in section Albus. J. Appl. Genet. 42 (4): 55 — 61.
Google Scholar
Autorzy
Anetta Kuczyńskaoffice@igr.poznan.pl
Instytut Genetyki Roślin Polskiej Akademii Nauk w Poznaniu Poland
Autorzy
Jan BocianowskiInstytut Genetyki Roślin Polskiej Akademii Nauk w Poznaniu Poland
Autorzy
Piotr MasojćAkademia Rolnicza, Szczecin Poland
Autorzy
Maria SurmaInstytut Genetyki Roślin Polskiej Akademii Nauk w Poznaniu Poland
Autorzy
Tadeusz AdamskiInstytut Genetyki Roślin Polskiej Akademii Nauk w Poznaniu Poland
Statystyki
Abstract views: 358PDF downloads: 32
Licencja
Prawa autorskie (c) 2003 Anetta Kuczyńska, Jan Bocianowski, Piotr Masojć, Maria Surma, Tadeusz Adamski
Utwór dostępny jest na licencji Creative Commons Uznanie autorstwa – Na tych samych warunkach 4.0 Miedzynarodowe.
Z chwilą przekazania artykułu, Autorzy udzielają Wydawcy niewyłącznej i nieodpłatnej licencji na korzystanie z artykułu przez czas nieokreślony na terytorium całego świata na następujących polach eksploatacji:
- Wytwarzanie i zwielokrotnianie określoną techniką egzemplarzy artykułu, w tym techniką drukarską oraz techniką cyfrową.
- Wprowadzanie do obrotu, użyczenie lub najem oryginału albo egzemplarzy artykułu.
- Publiczne wykonanie, wystawienie, wyświetlenie, odtworzenie oraz nadawanie i reemitowanie, a także publiczne udostępnianie artykułu w taki sposób, aby każdy mógł mieć do niego dostęp w miejscu i w czasie przez siebie wybranym.
- Włączenie artykułu w skład utworu zbiorowego.
- Wprowadzanie artykułu w postaci elektronicznej na platformy elektroniczne lub inne wprowadzanie artykułu w postaci elektronicznej do Internetu, lub innej sieci.
- Rozpowszechnianie artykułu w postaci elektronicznej w internecie lub innej sieci, w pracy zbiorowej jak również samodzielnie.
- Udostępnianie artykułu w wersji elektronicznej w taki sposób, by każdy mógł mieć do niego dostęp w miejscu i czasie przez siebie wybranym, w szczególności za pośrednictwem Internetu.
Autorzy poprzez przesłanie wniosku o publikację:
- Wyrażają zgodę na publikację artykułu w czasopiśmie,
- Wyrażają zgodę na nadanie publikacji DOI (Digital Object Identifier),
- Zobowiązują się do przestrzegania kodeksu etycznego wydawnictwa zgodnego z wytycznymi Komitetu do spraw Etyki Publikacyjnej COPE (ang. Committee on Publication Ethics), (http://ihar.edu.pl/biblioteka_i_wydawnictwa.php),
- Wyrażają zgodę na udostępniane artykułu w formie elektronicznej na mocy licencji CC BY-SA 4.0, w otwartym dostępie (open access),
- Wyrażają zgodę na wysyłanie metadanych artykułu do komercyjnych i niekomercyjnych baz danych indeksujących czasopisma.
Inne teksty tego samego autora
- Jan Bocianowski, Łukasz Stępień, Porównanie pięciu miar zróżnicowania genetycznego polskich odmian pszenicy ocenianych na podstawie danych z analiz markerów mikrosatelitarnych , Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin: Nr 242 (2006): Wydanie regularne
- Ewa Bakinowska, Jan Bocianowski, Anna Budka, Wiesław Pilarczyk, Bogna Zawieja, Katarzyna Ambroży, Estymacja wariancji błędu w hodowlanych doświadczeniach jednopowtórzeniowych z replikowanymi obiektami wzorcowymi , Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin: Nr 251 (2009): Wydanie regularne
- Wojciech Rybiński, Jan Bocianowski, Zmienność cech ilościowych roślin lędźwianu siewnego (Lathyrus sativus L.) pokolenia M1 uzyskanego działaniem chemomutagenów , Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin: Nr 240/241 (2006): Wydanie regularne
- Jan Bocianowski, Tadeusz Łuczkiewicz, Piotr Szulc, Wpływ ośmiu cech ilościowych rzepaku jarego (Brassica napus ssp. oleifera) na masę nasion z rośliny , Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin: Nr 264 (2012): Wydanie regularne
- Jan Bocianowski, Paweł Krajewski, Porównanie dwóch metod estymacji efektu addytywnego działania genów na podstawie linii podwojonych haploidów jęczmienia , Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin: Nr 226/227 (2003): Wydanie regularne
- Wojciech Rybiński, Tadeusz Adamski, Maria Surma, Zmienność dwu- i sześciorzędowych linii DH jęczmienia jarego pod względem cech struktury plonu , Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin: Nr 226/227 (2003): Wydanie regularne
- Stanisław Stawiński, Wojciech Rybiński, Jan Bocianowski, Ocena cech ilościowych trzech gatunków łubinu po działaniu chemomutagenów , Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin: Nr 226/227 (2003): Wydanie regularne
- Zygmunt Kaczmarek, Tomasz Warzecha, Tadeusz Adamski, Maria Surma, Wielowymiarowe podejście do oceny redukcji cech struktury plonu nagich i oplewionych linii DH jęczmienia inokulowanych Fusarium culmorum , Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin: Nr 226/227 (2003): Wydanie regularne
- Zygmunt Kaczmarek, Henryk Woś, Elżbieta Adamska, Tadeusz Adamski, Roman Biliński, Grzegorz Budzianowski, Łukasz Mańkowski, Ewelina Majchrzak, Janina Woś, Laurencja Szała, Teresa Cegielska-Taras, Renata Trzeciak, Ocena linii rodzicielskich rzepaku ozimego na podstawie plonu mieszańców z niekompletnego układu krzyżowania , Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin: Nr 277 (2015): Wydanie regularne
- Kami Nowosad, Jan Bocianowski, Hanna Szajsner, Anna Koszelnik-Leszek, Ogólna charakterystyka wybranych ekotypów Silene vulgaris , Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin: Nr 283 (2018): Wydanie specjalne
