Zastosowanie markerów RAPD do określenia podobieństwa genetycznego odmian jęczmienia ozimego (Hordeum vulgare L.)
Anetta Kuczyńska
office@igr.poznan.plInstytut Genetyki Roślin Polskiej Akademii Nauk w Poznaniu (Poland)
Jan Bocianowski
Instytut Genetyki Roślin Polskiej Akademii Nauk w Poznaniu (Poland)
Piotr Masojć
Akademia Rolnicza, Szczecin (Poland)
Maria Surma
Instytut Genetyki Roślin Polskiej Akademii Nauk w Poznaniu (Poland)
Tadeusz Adamski
Instytut Genetyki Roślin Polskiej Akademii Nauk w Poznaniu (Poland)
Abstrakt
Celem pracy było zbadanie zróżnicowania odmian jęczmienia ozimego na poziomie molekularnym. Materiał do badań stanowiło osiem odmian: Marinka, Gil, Tramp, Kroton, Tiffany, Horus, Kos oraz Sigra. Realizując cel pracy przeprowadzono reakcje RAPD-PCR dla 24 10-nukleotydowych starterów, wybranych wcześniej spośród 300 o losowej sekwencji. W wyniku reakcji otrzymano 172 zamplifikowane fragmenty DNA, z których 115 wykazywało polimorfizm. Obliczono współczynniki podobieństwa genetycznego według Nei’a, które posłużyły do hierarchicznego pogrupowania odmian. Wyniki grupowania przedstawiono w postaci dendrogramu. Największe podobieństwo wykazały pary Tiffany i Horus oraz Marinka i Kos, natomiast najmniej podobne okazały się Kroton i Tiffany oraz Kroton i Sigra.
Słowa kluczowe:
hierarchiczne grupowanie, jęczmień, podobieństwo genetyczne, RAPDBibliografia
Barua U. M., Chalmers K. J., Hackett C. A., Thomas W. T. B., Powell W., Waugh R. 1993. Identification of RAPD markers linked to a Rhynchosporium secalis resistance locus in barley using near-isogenic lines and bulked segregant analysis. Heredity 71: 177 — 184.
DOI: https://doi.org/10.1038/hdy.1993.122
Google Scholar
Bustos De A., Casanova C., Soler C., Jouve N. 1998. RAPD variation in wild populations of four species of the genus Hordeum (Poaceae). Theor. Appl. Genet. 96: 101 — 111.
DOI: https://doi.org/10.1007/s001220050715
Google Scholar
Hang A., Burton C. S., Hoffman D. L., Jones B. L. 2000. Random amplified polymorphic primer-generated embryo DNA polymorphisms among 16 North American malting barley cultivars. J. Am. Soc. Brew. Chem. 58 (4): 147 — 151.
DOI: https://doi.org/10.1094/ASBCJ-58-0147
Google Scholar
Kuczyńska A., Milczarski P., Surma M., Masojć P., Adamski T. 2001. Genetic diversity among cultivars of spring barley revealed by random amplified polymorphic DNA (RAPD). J. Appl. Genet. 42 (1): 43 — 48.
Google Scholar
Marczewski W. 1995. Markery molekularne w genetyce i hodowli roślin. Postępy Biochemii 41 (4): 237 — 243.
Google Scholar
Nei M., Li W. H. 1979. Mathematical model for studying genetic variation in terms of restriction. Proceedings of the Academy of Sciences of the USA 76: 5269 — 5273.
DOI: https://doi.org/10.1073/pnas.76.10.5269
Google Scholar
Przyborowski J. A., Weeden N. F. 2001. RAPD-based assessment of genetic similarity and distance between Lupinus in section Albus. J. Appl. Genet. 42 (4): 55 — 61.
Google Scholar
Autorzy
Anetta Kuczyńskaoffice@igr.poznan.pl
Instytut Genetyki Roślin Polskiej Akademii Nauk w Poznaniu Poland
Autorzy
Jan BocianowskiInstytut Genetyki Roślin Polskiej Akademii Nauk w Poznaniu Poland
Autorzy
Piotr MasojćAkademia Rolnicza, Szczecin Poland
Autorzy
Maria SurmaInstytut Genetyki Roślin Polskiej Akademii Nauk w Poznaniu Poland
Autorzy
Tadeusz AdamskiInstytut Genetyki Roślin Polskiej Akademii Nauk w Poznaniu Poland
Statystyki
Abstract views: 358PDF downloads: 32
Licencja
Prawa autorskie (c) 2003 Anetta Kuczyńska, Jan Bocianowski, Piotr Masojć, Maria Surma, Tadeusz Adamski
Utwór dostępny jest na licencji Creative Commons Uznanie autorstwa – Na tych samych warunkach 4.0 Miedzynarodowe.
Z chwilą przekazania artykułu, Autorzy udzielają Wydawcy niewyłącznej i nieodpłatnej licencji na korzystanie z artykułu przez czas nieokreślony na terytorium całego świata na następujących polach eksploatacji:
- Wytwarzanie i zwielokrotnianie określoną techniką egzemplarzy artykułu, w tym techniką drukarską oraz techniką cyfrową.
- Wprowadzanie do obrotu, użyczenie lub najem oryginału albo egzemplarzy artykułu.
- Publiczne wykonanie, wystawienie, wyświetlenie, odtworzenie oraz nadawanie i reemitowanie, a także publiczne udostępnianie artykułu w taki sposób, aby każdy mógł mieć do niego dostęp w miejscu i w czasie przez siebie wybranym.
- Włączenie artykułu w skład utworu zbiorowego.
- Wprowadzanie artykułu w postaci elektronicznej na platformy elektroniczne lub inne wprowadzanie artykułu w postaci elektronicznej do Internetu, lub innej sieci.
- Rozpowszechnianie artykułu w postaci elektronicznej w internecie lub innej sieci, w pracy zbiorowej jak również samodzielnie.
- Udostępnianie artykułu w wersji elektronicznej w taki sposób, by każdy mógł mieć do niego dostęp w miejscu i czasie przez siebie wybranym, w szczególności za pośrednictwem Internetu.
Autorzy poprzez przesłanie wniosku o publikację:
- Wyrażają zgodę na publikację artykułu w czasopiśmie,
- Wyrażają zgodę na nadanie publikacji DOI (Digital Object Identifier),
- Zobowiązują się do przestrzegania kodeksu etycznego wydawnictwa zgodnego z wytycznymi Komitetu do spraw Etyki Publikacyjnej COPE (ang. Committee on Publication Ethics), (http://ihar.edu.pl/biblioteka_i_wydawnictwa.php),
- Wyrażają zgodę na udostępniane artykułu w formie elektronicznej na mocy licencji CC BY-SA 4.0, w otwartym dostępie (open access),
- Wyrażają zgodę na wysyłanie metadanych artykułu do komercyjnych i niekomercyjnych baz danych indeksujących czasopisma.
Inne teksty tego samego autora
- Maria Surma, Tadeusz Adamski, Andrzej Bichoński, Zdzisław Biliński, Zbigniew Bystry, Piotr Jarosz, Zygmunt Kaczmarek, Anetta Kuczyńska, Karolina Krystkowiak, Wojciech Mikulski, Jadwiga Nadziak, Wanda Orłowska-Job, Zdzisław Paszkiewicz, Michał Rębarz, Anna Sybilska, Fenotypowe i genetyczne zróżnicowanie rodów jęczmienia jarego , Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin: Nr 236 (2005): Wydanie regularne
- Katarzyna Pankiewicz, Tadeusz Adamski, Zygm Kaczmarek, Maria Surma, Michał Rębarz, Molekularne i fenotypowe zróżnicowanie odmian i linii podwojonych haploidów pszenicy (Triticum aestivum L.) , Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin: Nr 244 (2007): Wydanie regularne
- Tadeusz Adamski, Zygmunt Kaczmarek, Maria Surma, Stanisław Czajka, Karolina Krystkowiak, Anetta Kuczyńska, Michał Rębarz, Wykorzystanie linii podwojonych haploidów do wykrywania sprzężeń genów kontrolujących wybrane cechy ilościowe jęczmienia , Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin: Nr 231 (2004): Wydanie regularne
- Magdalena Pol-Szyszko, Piotr Masojč, Izabela Doniec, Agnieszka Wenda, Ocena aktywności α-amylazy w ziarnie odmian kukurydzy zwyczajnej (Zea mays L.) w aspekcie ich wykorzystania do produkcji bioetanolu , Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin: Nr 254 (2009): Wydanie regularne
- Stefan Stojałowski, Paweł Milczarski, Piotr Masojć, Przydatność markerów ISSR do identyfikacji linii wsobnych oraz mapowania genomu żyta , Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin: Nr 231 (2004): Wydanie regularne
- Karolina Krystkowiak, Anetta Kuczyńska, Michał Rębarz, Renata Trzeciak, Efektywność uzyskiwania haploidów pszenicy z mieszańców F1 i ich form wyjściowych poprzez krzyżowanie z kukurydzą , Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin: Nr 231 (2004): Wydanie regularne
- Wojciech Mikulski, Aleksandra Ponitka, Aurelia Ślusarkiewicz-Jarzina, Paweł Dopierała, Maria Surma, Tadeusz Adamski, Zygmunt Kaczmarek, Ocena wartości gospodarczej linii podwojonych haploidów pszenżyta ozimego , Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin: Nr 218/219 (2001): Wydanie regularne
- Piotr Masojć, Ocena wartości hodowlanej rodów żyta o podwyższonej odporności na porastanie , Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin: Nr 218/219 (2001): Wydanie regularne
- Paweł Milczarski, Aneta Banek-Tabor, Piotr Masojć, Wykorzystanie markerów RAPD do identyfikacji odmian pszenżyta , Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin: Nr 218/219 (2001): Wydanie regularne
