Wydzielanie grup miejscowości na podstawie serii doświadczeń wielokrotnych ze zmiennym składem odmian w latach przy użyciu pakietu SEQRET. Część I. Teoretyczne podstawy analizy retrospektywnej
Anna Rajfura
anna_rajfura@sggw.edu.plKatedra Doświadczalnictwa i Bioinformatyki, Szkoła Główna Gospodarstwa Wiejskiego w Warszawie (Poland)
Wiesław Mądry
Katedra Doświadczalnictwa i Bioinformatyki, Szkoła Główna Gospodarstwa Wiejskiego w Warszawie (Poland)
Abstrakt
W pracy przedstawiono teoretyczne podstawy analizy retrospektywnej na niekompletnych danych historycznych pochodzących z wieloletnich serii doświadczeń w wielu miejscowościach. Analiza ta stanowi integralną część metody pattern analysis i stosuje się do wydzielania grup miejscowości, w których odmiany są podobnie zróżnicowane pod względem plonu. Praca prezentuje aspekt wyzna-czania odległości pomiędzy miejscowościami uśrednionych poprzez lata. Opisana metodyka została wykorzystana w procedurach pakietu SEQRET, co zaprezentowano na przykładzie w Części II.
Słowa kluczowe:
retrospektywna sekwencyjna analiza skupień, niekompletne historyczne bazy danych, interakcja genotypowo-środowiskowaBibliografia
DeLacy I. H., Basford K. E., Cooper M., Fox P. N. 1996. Retrospective analysis of historical data sets from multi-environment trials-Theoretical development. In: Cooper M., Hammer G.L. (eds) Plant Adaptation and Crop Improvement. CAB International: 243 — 267.
Google Scholar
DeLacy I. H., Cooper M., Lawrence P. K. 1990. Pattern analysis over years of regional variety trials: relationship among sites. In: Kang M.S. (ed.) Genotype-by-Environment Interaction and Plant Breeding. Louisiana State University, Baton Rouge, Louisiana (12-13 February): 189 — 213.
Google Scholar
DeLacy I.H., Fox P.N., Corbett J.D., Crossa J., Rajaram S., Fisher R.A. and van Ginkel M. 1994. Long-term association of locations for testing spring bread wheat. Euphytica 72: 95 — 106.
Google Scholar
DeLacy I. H., Cooper M., Basford K. E. 1996. Relationships among analytical methods used to study genotype-by-environment interactions and evaluation of their impact on response to selection. In: Kang, M. S., Gauch, H.G. (eds) Genotype-by-Environment Interaction: New Perspectives. CRC Press, Boca Raton, Florida: 51 — 84.
Google Scholar
DeLacy I. H., Basford K. E., Cooper M., Fox P. N. 1998. The SEQRET Package: Computer Programs for Retrospective Pattern Analysis, Version 1.1. The University of Queensland, Brisbane 4072, Australia.
Google Scholar
Fox P. N., Rosielle A. A. 1982. Reducing the influence of environmental main-effects on pattern analysis of plant breeding environments. Euphytica 31: 645 — 656.
Google Scholar
Gauch H. G., Zobel R. W. 1997. Identifying mega-environments and targeting genotypes. Crop Sci. 37: 311 — 326.
Google Scholar
Lawrence P. K. and DeLacy I. H. 1993. Classification of locations in regional cotton variety trials where trial entries change over years. Field Crops Research 34: 195 — 207.
Google Scholar
Mirzawan P. D. N., Cooper M., DeLacy I. H., Hogarth D. M. 1994. Retrospective analysis of the relationships among the test environments of the Southern Queensland sugarcane breeding program. Theoretical and Applied Genetics 88: 707 — 716.
Google Scholar
Williams W. T. 1976. Pattern Analysis in Agricultural Science. Elsevier Scientific Publishing Company, Amsterdam.
Google Scholar
Zhang Y., He Z., Zhang A., van Ginkel M., Ye G. 2006. Pattern analysis on grain yield of Chinese and CIMMYT spring wheat cultivars grown in China and CIMMYT. Euphytica 147: 409 — 420.
Google Scholar
Autorzy
Anna Rajfuraanna_rajfura@sggw.edu.pl
Katedra Doświadczalnictwa i Bioinformatyki, Szkoła Główna Gospodarstwa Wiejskiego w Warszawie Poland
Autorzy
Wiesław MądryKatedra Doświadczalnictwa i Bioinformatyki, Szkoła Główna Gospodarstwa Wiejskiego w Warszawie Poland
Statystyki
Abstract views: 48PDF downloads: 13
Licencja
Prawa autorskie (c) 2008 Anna Rajfura, Wiesław Mądry
Utwór dostępny jest na licencji Creative Commons Uznanie autorstwa – Na tych samych warunkach 4.0 Miedzynarodowe.
Z chwilą przekazania artykułu, Autorzy udzielają Wydawcy niewyłącznej i nieodpłatnej licencji na korzystanie z artykułu przez czas nieokreślony na terytorium całego świata na następujących polach eksploatacji:
- Wytwarzanie i zwielokrotnianie określoną techniką egzemplarzy artykułu, w tym techniką drukarską oraz techniką cyfrową.
- Wprowadzanie do obrotu, użyczenie lub najem oryginału albo egzemplarzy artykułu.
- Publiczne wykonanie, wystawienie, wyświetlenie, odtworzenie oraz nadawanie i reemitowanie, a także publiczne udostępnianie artykułu w taki sposób, aby każdy mógł mieć do niego dostęp w miejscu i w czasie przez siebie wybranym.
- Włączenie artykułu w skład utworu zbiorowego.
- Wprowadzanie artykułu w postaci elektronicznej na platformy elektroniczne lub inne wprowadzanie artykułu w postaci elektronicznej do Internetu, lub innej sieci.
- Rozpowszechnianie artykułu w postaci elektronicznej w internecie lub innej sieci, w pracy zbiorowej jak również samodzielnie.
- Udostępnianie artykułu w wersji elektronicznej w taki sposób, by każdy mógł mieć do niego dostęp w miejscu i czasie przez siebie wybranym, w szczególności za pośrednictwem Internetu.
Autorzy poprzez przesłanie wniosku o publikację:
- Wyrażają zgodę na publikację artykułu w czasopiśmie,
- Wyrażają zgodę na nadanie publikacji DOI (Digital Object Identifier),
- Zobowiązują się do przestrzegania kodeksu etycznego wydawnictwa zgodnego z wytycznymi Komitetu do spraw Etyki Publikacyjnej COPE (ang. Committee on Publication Ethics), (http://ihar.edu.pl/biblioteka_i_wydawnictwa.php),
- Wyrażają zgodę na udostępniane artykułu w formie elektronicznej na mocy licencji CC BY-SA 4.0, w otwartym dostępie (open access),
- Wyrażają zgodę na wysyłanie metadanych artykułu do komercyjnych i niekomercyjnych baz danych indeksujących czasopisma.
Inne teksty tego samego autora
- Wiesław Mądry, Jakub Paderewski, Jan Rozbicki, Dariusz Gozdowski, Jan Golba, Mariusz Piechociński, Marcin Studnicki, Adriana Derejko, Plonowanie odmian pszenicy ozimej w różnych środowiskach — jednoroczna seria PDOiR , Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin: Nr 263 (2012): Wydanie regularne
- Dariusz Gozdowski, Danuta Martyniak, Wiesław Mądry, Wielowymiarowa ocena zróżnicowania odmian i rodów życicy trwałej pod względem cech użytkowych w uprawie na nasiona , Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin: Nr 253 (2009): Wydanie regularne
- Marzena Iwańska, Wiesław Mądry, Tadeusz Drzazga, Anna Rajfura, Zastosowanie miar statystycznych do oceny stopnia szerokiej adaptacji odmian pszenicy ozimej na podstawie serii doświadczeń przedrejestrowych , Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin: Nr 250 (2008): Wydanie regularne
- Wiesław Mądry, Dariusz Gozdowski, Jan Rozbicki, Mirosław Pojmaj, Stanisław Samborski, Związki między plonem ziarna a jego składowymi w populacji rodów hodowlanych pszenżyta ozimego w trzech stacjach doświadczalnych , Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin: Nr 245 (2007): Wydanie regularne
- Marcin Studnicki, Wiesław Mądry, Metodyka statystyczna pobierania próby do tworzenia kolekcji podstawowej roślinnych zasobów genowych: przegląd dorobku , Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin: Nr 263 (2012): Wydanie regularne
- Leszek Sieczko, Agnieszka Masny, Wiesław Mądry, Edward Żurawicz, Analiza podobieństwa rodzin mieszańcowych truskawki powtarzającej owocowanie pod względem wielkości i jakości plonu owoców , Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin: Nr 250 (2008): Wydanie regularne
- Dariusz Gozdowski, Danuta Martyniak, Wiesław Mądry, Zastosowanie analizy ścieżek do oceny determinacji plonu nasion życicy trwałej , Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin: Nr 247 (2008): Wydanie regularne
- Marzena Iwańska, Wiesław Mądry, Anna Rajfura, Tadeusz Drzazga, Porównanie syntetycznych wskaźników stopnia szerokiej adaptacji odmian na przykładzie serii doświadczeń przedrejestrowych z pszenicą ozimą , Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin: Nr 253 (2009): Wydanie regularne
