An introduction to multivariate statistical analyses. Part II. The application

Zygmunt Kaczmarek


Instytut Genetyki Roślin, Polskiej Akademii Nauk w Poznaniu, Pracownia Biometrii (Poland)

Dariusz R. Mańkowski

d.mankowski@ihar.edu.pl
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin — Państwowy Instytut Badawczy w Radzikowie, Pracownia Ekonomiki Nasiennictwa i Hodowli Roślin (Poland)
https://orcid.org/0000-0002-7499-8016

Abstract

While conducting research and analysing experimental data, one often observes and analyses multiple characteristics of certain experimental objects. Often each of these characteristics is analyzed separately. However, to have a complete picture emerging from the research you should use multivariate analysis which allowing a holistic approach to the investigation of the problem. The paper presents a practical example of the calculation methods of multivariate statistical analysis formally described in the first part. In particular, this paper presents the MANOVA analysis and an analysis of contrasts and canonical variables analysis associated with it.


Keywords:

multivariate analysis, multivariate grouping, spring barley, correlation matrix, covariance matrix, MANOVA, multivariate similarity measures

Anderberg M.R. 1973. Cluster analysis for applications. Academic Press, New York.
Google Scholar

Caliński T. 1970. Wielozmienna analiza wariancji i pokrewne metody wielowymiarowe. PAN, Warszawa.
Google Scholar

Caliński T., Czajka S., Kaczmarek Z. 1975. Analiza składowych głównych i jej zastosowania. Algorytmy biometryczne i statystyczne (ABS-36). AR Poznań.
Google Scholar

Caliński T., Dyczkowski A., Kaczmarek Z. 1976. Testowanie hipotez w wielozmiennej analizie wariancji i kowariancji. Algorytmy biometryczne i statystyczne (ABS-45). AR Poznań.
Google Scholar

Caliński T., Kaczmarek Z. 1973. Metody kompleksowej analizy doświadczenia wielocechowego. Trzecie Colloquium Metodologiczne z Agro-Biometrii, PAN i PTB Warszawa: 257 — 320.
Google Scholar

Ceranka B., Chudzik H., Kaczmarek Z., Krzyśko M. 1975. Wielozmienna analiza wyników doświadczeń w układach blokowych. Algorytmy biometryczne i statystyczne (ABS-35). AR Poznań.
Google Scholar

Crossa J., Franco J. 2004. Statistical methods for classifying genotypes. Euphytica, 137: 19 — 37.
Google Scholar

Daoyu Z., Lawes G. S. 2000. Manova and discriminant analyses of phenotypic data as a guide for parent selection in kiwifruit (Actinidia deliciosa) breeding. Euphytica, 114: 151 — 157.
Google Scholar

Kaczmarek Z. 1975. Wielozmienna analiza kowariancji i jej niektóre zastosowania. Matematyka Stosowana 5: 139 — 156.
Google Scholar

Kaczmarek Z., Czajka S., Adamska E. 2008. Propozycja metody grupowania obiektów jedno- i wielocechowych z zastosowaniem odległości Mahalanobisa i analizy skupień. Biul.IHAR 249: 9 — 18.
Google Scholar

Kaczmarek Z., Mańkowski D. R. 2011. Wprowadzenie do statystycznych analiz wielozmiennych. Część I. Podstawy teoretyczne. Biuletyn IHAR, w druku.
Google Scholar

Kenga R., Tenkouano A., Gupta S. C., Alabi S. O. 2006. Genetic and phenotypic association between yield components in hybrid sorgum (Sorgum bicolor (L.) Moench) populations. Euphytica, 150: 319 — 326.
Google Scholar

Krzyśko M. 2000. Wielowymiarowa analiza statystyczna. Uniwersytet im. A. Mickiewicza w Poznaniu. Poznań.
Google Scholar

Mądry W., Mańkowski D. R., Kaczmarek Z., Krajewski P., Studnicki M. 2010. Metody statystyczne oparte na modelach liniowych w zastosowaniach do doświadczalnictwa, genetyki i hodowli roślin. Monografie i Rozprawy Naukowe IHAR Radzików, nr 34.
Google Scholar

Morrison D. F. 1976. Multivariate statistical methods. McGraw-Hill. New York.
Google Scholar

Nyassé S., Despréaux D., Cilas C. Validity of a leaf inoculation test to assess the resistance to Phytophthora megakarya in a cocoa (Theobroma cacao L.) diallel mating design. Euphytica, 123: 395 — 399.
Google Scholar

SAS Institute Inc. 2009. SAS/STAT 9.2 User’s Guide, Second Edition. Cary, NC, USA: SAS Publishing, SAS Institute Inc.
Google Scholar

Seber G.A.F. 1984. Multivariate observations. Wiley. New York.
Google Scholar

Timm N. H. 2002. Applied multivariate analysis. New York, USA: Springer-Verlag Inc.
Google Scholar

Ukalska J., Mądry W., Ukalski K., Masny A. 2007. Wielowymiarowa ocena różnorodności fenotypowej w kolekcji zasobów genowych truskawki. Cz. II. Grupowanie genotypów. Zesz. Probl. Post. Nauk Rol. 517: 759 — 766.
Google Scholar

Ukalska J., Ukalski K., Śmiałowski T., Mądry W. 2008. Badanie zmienności i współzależności cech użytkowych w kolekcji roboczej pszenicy ozimej (Triticum aestivum L.) za pomocą metod wielowy-miarowych. Cz. II. Analiza składowych głównych na podstawie macierzy korelacji fenotypowych i genotypowych. Biul. IHAR 249: 45 — 57.
Google Scholar


Published
2011-03-31

Cited by

Kaczmarek, Z. and Mańkowski, D. R. (2011) “An introduction to multivariate statistical analyses. Part II. The application”, Bulletin of Plant Breeding and Acclimatization Institute, (259), pp. 35–49. doi: 10.37317/biul-2011-0055.

Authors

Zygmunt Kaczmarek 

Instytut Genetyki Roślin, Polskiej Akademii Nauk w Poznaniu, Pracownia Biometrii Poland

Authors

Dariusz R. Mańkowski 
d.mankowski@ihar.edu.pl
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin — Państwowy Instytut Badawczy w Radzikowie, Pracownia Ekonomiki Nasiennictwa i Hodowli Roślin Poland
https://orcid.org/0000-0002-7499-8016

Statistics

Abstract views: 33
PDF downloads: 38


License

Copyright (c) 2011 Zygmunt Kaczmarek, Dariusz R. Mańkowski

Creative Commons License

This work is licensed under a Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License.

Upon submitting the article, the Authors grant the Publisher a non-exclusive and free license to use the article for an indefinite period of time throughout the world in the following fields of use:

  1. Production and reproduction of copies of the article using a specific technique, including printing and digital technology.
  2. Placing on the market, lending or renting the original or copies of the article.
  3. Public performance, exhibition, display, reproduction, broadcasting and re-broadcasting, as well as making the article publicly available in such a way that everyone can access it at a place and time of their choice.
  4. Including the article in a collective work.
  5. Uploading an article in electronic form to electronic platforms or otherwise introducing an article in electronic form to the Internet or other network.
  6. Dissemination of the article in electronic form on the Internet or other network, in collective work as well as independently.
  7. Making the article available in an electronic version in such a way that everyone can access it at a place and time of their choice, in particular via the Internet.

Authors by sending a request for publication:

  1. They consent to the publication of the article in the journal,
  2. They agree to give the publication a DOI (Digital Object Identifier),
  3. They undertake to comply with the publishing house's code of ethics in accordance with the guidelines of the Committee on Publication Ethics (COPE), (http://ihar.edu.pl/biblioteka_i_wydawnictwa.php),
  4. They consent to the articles being made available in electronic form under the CC BY-SA 4.0 license, in open access,
  5. They agree to send article metadata to commercial and non-commercial journal indexing databases.

Most read articles by the same author(s)

1 2 3 4 5 > >>