Analiza podobieństwa genetycznego odmian orkiszu (Triticum aestivum ssp. spelta L.) za pomocą markerów RAPD
Sylwia Okoń
sylwia.okon@up.lublin.plInstytut Genetyki, Hodowli I Biotechnologii Roślin, Uniwersytet Przyrodniczy w Lublinie (Poland)
Edyta Paczos-Grzęda
Instytut Genetyki, Hodowli I Biotechnologii Roślin, Uniwersytet Przyrodniczy w Lublinie (Poland)
Piotr Kraska
Katedra Ekologii Rolniczej, Uniwersytet Przyrodniczy w Lublinie (Poland)
Ewa Kwiecińska-Poppe
Katedra Ekologii Rolniczej, Uniwersytet Przyrodniczy w Lublinie (Poland)
Edward Pałys
Katedra Ekologii Rolniczej, Uniwersytet Przyrodniczy w Lublinie (Poland)
Abstrakt
W pracy przedstawiono analizę podobieństwa genetycznego 8 odmian pszenicy orkisz (Triticum aestivum ssp. spelta L.) za pomocą markerów RAPD. Dla 17 wyselekcjonowanych starterów uzyskano 175 produktów, z których 80 było polimorficznych, zaś 7 specyficznych dla pojedynczych obiektów. Średnie podobieństwo genetyczne określone pomiędzy parami wszystkich badanych form wyniosło 0,868. Na podstawie matryc indeksów podobieństwa genetycznego wykonano analizę skupień metodą średnich połączeń UPGMA. Na podstawie przeprowadzonych badań można stwierdzić, że analizowane odmiany orkiszu charakteryzowały się wysokim podobieństwem genetycznym.
Słowa kluczowe:
podobieństwo genetyczne, RAPD, Triticum aestivum ssp. spelta L.Bibliografia
Achleitner A., Tinker N.A., Zechner E., Buerstmayr H. 2008. Genetic diversity among oat varieties of worldwide origin and associations of AFLP markers with quantitative traits. Theor. Appl. Genet. 117: 1041 — 1053.
Google Scholar
Baumagärtel-Blaschke U. 1991. Dinkel für die neue deutsche Küche. DLG — Mitteilungen, 106, 12: 44 — 47.
Google Scholar
Cheng Z., Huang H. 2009. SSR fingerprinting Chinese peach cultivars and landraces (Prunus persica) and analysis of their genetic relationships. Scientia Hortic. 120: 188 — 193.
Google Scholar
Doyle J. J., Doyle J. L. 1987. A rapid DNA isolation procedure for small quantities of fresh leaf tissue. Phytochem. Bull. 19: 11 — 15.
Google Scholar
Drossou A., Katsiotis A., Leggett J. M., Loukas M., Tsakas S. 2004. Genome and species relationships in genus Avena based on RAPD and AFLP molecular markers. Theor. Appl. Genet. 109: 48 — 54.
Google Scholar
Du J. K., Yao Y. Y., Ni Z. F., Peng H. R., Sun Q. X. 2002. Genetic diversity revealed by ISSR molecular marker in common wheat, spelt, compacted and progeny of recurrent selection. Acta Genet. Sin. 29 (5): 445 — 452.
Google Scholar
Grela E., Pałys E., Günther K. D. 1993. Skład chemiczny i wartość pokarmowa ziarna orkiszu (Triticum spelta) w żywieniu świń. Mat. Sympozjum Naukowego nt.: „Produkcja zwierzęca a środowisko przyrodnicze”. Wyd. AR Lublin, 214 — 222.
Google Scholar
Ikegami H., Nogata H., Hirashima K., Awamura M., Nakahara T. 2009. Analysis of genetic diversity among European and Asian fig varieties (Ficus carica L.) using ISSR, RAPD, and SSR markers. Genet. Resour. Crop Evol. 56:201 — 209.
Google Scholar
Kochieva E. Z., Goryunova S. V., Pomortsev A. A. 2001. RAPD analysis of the genome in species of the genus Hordeum. Rus. J. Genet. 37 (8): 905 — 910.
Google Scholar
Marillia E. F., Scoles G. J. 1996. The use of RAPD markers in Hordeum phylogeny. Genome 39 (4): 646 — 54.
Google Scholar
Nei M., Li W. H. 1979. Mathematical model for studying genetic variation in terms of restriction endonucleases. Proc Natl Acad Sci. 76: 5269 — 5273.
Google Scholar
Rohlf F. J. 2001. NTSYS-pc numerical taxonomy and multivariate analysis system. Version 5.1.Exeter Publishing Ltd., Setauket, N.Y.
Google Scholar
Sun Q., Ni Z., Liu Z., Gao J., Huang T. 1998. Genetic relationships and diversity among Tibetan wheat, common wheat and European spelt wheat revealed by RAPD markers. Euphytica 99: 205 — 211.
Google Scholar
Sztuba-Solińska J. 2005. Systemy markerów molekularnych i ich zastosowanie w hodowli roślin. Kosmos 54 (2–3): 227 — 239.
Google Scholar
Vinod K. Y., Sandeep K., Ravindra K. P. 2007. Measurement of genetic dissimilarity in fieldpea (Pisum sativum L.) genotypes using RAPD markers. Genet. Resour. Crop Evol. 54 (6): 1285 — 1289.
Google Scholar
Virk P. S., Ford-Lloyd B. V., Jackson M. T., Newbury H. J. 1995 Use of RAPD for the study of diversity within plant germplasm collections. Heredity 74: 170 — 179.
Google Scholar
Williams J. G. K., Kubelik A. R., Livak K. J., Rafalski J. A, Tingey S. V. 1990. DNA polymorphisms amplified by arbitrary primers are useful as genetic markers. Nucl. Acid. Res. 18: 6531 — 6535.
Google Scholar
Yang X., Liu P., Han Z., NI Z., Sun Q. 2005. Genetic diversity revealed by genomic-SSR and EST-SSR markers among common wheat, spelt and compacted. Progr. Nat. Sci. 15 (1):24 — 33.
Google Scholar
Autorzy
Sylwia Okońsylwia.okon@up.lublin.pl
Instytut Genetyki, Hodowli I Biotechnologii Roślin, Uniwersytet Przyrodniczy w Lublinie Poland
Autorzy
Edyta Paczos-GrzędaInstytut Genetyki, Hodowli I Biotechnologii Roślin, Uniwersytet Przyrodniczy w Lublinie Poland
Autorzy
Piotr KraskaKatedra Ekologii Rolniczej, Uniwersytet Przyrodniczy w Lublinie Poland
Autorzy
Ewa Kwiecińska-PoppeKatedra Ekologii Rolniczej, Uniwersytet Przyrodniczy w Lublinie Poland
Autorzy
Edward PałysKatedra Ekologii Rolniczej, Uniwersytet Przyrodniczy w Lublinie Poland
Statystyki
Abstract views: 35PDF downloads: 39
Licencja
Prawa autorskie (c) 2009 Sylwia Okoń, Edyta Paczos-Grzęda, Piotr Kraska, Ewa Kwiecińska-Poppe, Edward Pałys
Utwór dostępny jest na licencji Creative Commons Uznanie autorstwa – Na tych samych warunkach 4.0 Miedzynarodowe.
Z chwilą przekazania artykułu, Autorzy udzielają Wydawcy niewyłącznej i nieodpłatnej licencji na korzystanie z artykułu przez czas nieokreślony na terytorium całego świata na następujących polach eksploatacji:
- Wytwarzanie i zwielokrotnianie określoną techniką egzemplarzy artykułu, w tym techniką drukarską oraz techniką cyfrową.
- Wprowadzanie do obrotu, użyczenie lub najem oryginału albo egzemplarzy artykułu.
- Publiczne wykonanie, wystawienie, wyświetlenie, odtworzenie oraz nadawanie i reemitowanie, a także publiczne udostępnianie artykułu w taki sposób, aby każdy mógł mieć do niego dostęp w miejscu i w czasie przez siebie wybranym.
- Włączenie artykułu w skład utworu zbiorowego.
- Wprowadzanie artykułu w postaci elektronicznej na platformy elektroniczne lub inne wprowadzanie artykułu w postaci elektronicznej do Internetu, lub innej sieci.
- Rozpowszechnianie artykułu w postaci elektronicznej w internecie lub innej sieci, w pracy zbiorowej jak również samodzielnie.
- Udostępnianie artykułu w wersji elektronicznej w taki sposób, by każdy mógł mieć do niego dostęp w miejscu i czasie przez siebie wybranym, w szczególności za pośrednictwem Internetu.
Autorzy poprzez przesłanie wniosku o publikację:
- Wyrażają zgodę na publikację artykułu w czasopiśmie,
- Wyrażają zgodę na nadanie publikacji DOI (Digital Object Identifier),
- Zobowiązują się do przestrzegania kodeksu etycznego wydawnictwa zgodnego z wytycznymi Komitetu do spraw Etyki Publikacyjnej COPE (ang. Committee on Publication Ethics), (http://ihar.edu.pl/biblioteka_i_wydawnictwa.php),
- Wyrażają zgodę na udostępniane artykułu w formie elektronicznej na mocy licencji CC BY-SA 4.0, w otwartym dostępie (open access),
- Wyrażają zgodę na wysyłanie metadanych artykułu do komercyjnych i niekomercyjnych baz danych indeksujących czasopisma.
Inne teksty tego samego autora
- Krzysztof Kowalczyk, Sylwia Okoń, Analiza zmienności allelicznej w locus Xgwm261 w odmianach pszenicy zwyczajnej (Triticum aestivum L.) zarejestrowanych w Polsce w latach 1978–2006 , Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin: Nr 252 (2009): Wydanie regularne
- Dr Edyta Paczos-Grzęda , Sylwia Sowa , Aneta Koroluk , Joanna Toporowska , Ewelina Marek , Piotr Bednarek , Mapowanie sprzężeniowe i asocjacyjne owsa zwyczajnego , Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin: Nr 286 (2019): Wydanie specjalne
- Dr Edyta Paczos-Grzęda , Sylwia Sowa, Aneta Koroluk, Joanna Toporowska, Ewelina Marek, Piramidyzacja genów odporności na rdzę koronową w genomie owsa oraz identyfikacja i lokalizacja markerów DNA dla tych genów , Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin: Nr 286 (2019): Wydanie specjalne
- Piotr Kraska, Wpływ zróżnicowanych dawek herbicydów na plonowanie i zawartość makroelementów w ziarnie pszenicy ozimej , Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin: Nr 246 (2007): Wydanie regularne
- Piotr Kraska, Jakość ziarna pszenicy jarej uprawianej w monokulturze w zależności od konserwujących wariantów uprawy roli oraz międzyplonów , Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin: Nr 256 (2010): Wydanie regularne
- Prof. dr hab. Sylwia Okoń , Tomasz Ociepa, Aleksandra Nucia, Identyfikacja i lokalizacja markerów DNA dla wybranych genów odporności na mączniaka prawdziwego w owsie zwyczajnym oraz piramidyzacja efektywnych genów odporności w genomie owsa , Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin: Nr 286 (2019): Wydanie specjalne
- Sylwia Andruszczak, Piotr Kraska, Ewa Kwiecińska-Poppe, Edward Pałys, Wpływ wsiewek międzyplonowych oraz stosowania herbicydu Chwastox Extra 300 SL na plon ziarna i elementy plonowania jęczmienia jarego uprawianego w monokulturze , Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin: Nr 259 (2011): Wydanie regularne
- Maria Chrząstek, Katarzyna Kruk, Sylwia Okoń, Emilia Wojtowicz, Wpływ formy ojcowskiej na żywotność pyłku i niektóre cechy plonotwórcze mieszańców międzygatunkowych Avena sativa L. cv. Borowiak × Avena sterilis L. , Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin: Nr 252 (2009): Wydanie regularne
- Edyta Paczos-Grzęda, Zastosowanie metod RAPD i SSR do oceny podobieństwa genetycznego tetraploidalnych gatunków z rodzaju Avena L. , Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin: Nr 252 (2009): Wydanie regularne
- Edyta Paczos-Grzęda, Katarzyna Kruk, Sylwia Okoń, Ocena wewnątrzgatunkowego podobieństwa genetycznego Avena fatua L. w oparciu o polimorfizm DNA , Biuletyn Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin: Nr 252 (2009): Wydanie regularne
